RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 PP632Q6XCG6 107 aa8.44□□□□□ -1.06
SH3BP5-208ENST00000459627 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.39□□□□□ -1.07
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.38□□□□□ -1.07
SH3BP5-208ENST00000459627 PSPHP1O15172 72 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP12-3P60328 96 aa8.26□□□□□ -1.09
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE1DQ5T752 114 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP5-208ENST00000459627 Q1T7F1 81 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 V9GYY9 64 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP5-208ENST00000459627 K7ERS5 55 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 MT4P47944 62 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.13□□□□□ -1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE4AQ5TA78 99 aa8.1□□□□□ -1.11
SH3BP5-208ENST00000459627 HMCN1Q96RW7 5635 aa8.04□□□□□ -1.12
SH3BP5-208ENST00000459627 A6NED7 52 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.98□□□□□ -1.13
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.91□□□□□ -1.14
SH3BP5-208ENST00000459627 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.86□□□□□ -1.15
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.79□□□□□ -1.16
SH3BP5-208ENST00000459627 PCP4P48539 62 aa7.78□□□□□ -1.16
SH3BP5-208ENST00000459627 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.77□□□□□ -1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.75□□□□□ -1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.75□□□□□ -1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.72□□□□□ -1.17
SH3BP5-208ENST00000459627 ROMO1P60602 79 aa7.66□□□□□ -1.18
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.58□□□□□ -1.2
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.57□□□□□ -1.2
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP12-4P60329 112 aa7.48□□□□□ -1.21
SH3BP5-208ENST00000459627 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.46□□□□□ -1.22
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1AP04731 61 aa7.23□□□□□ -1.25
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 BRK1Q8WUW1 75 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-8O75690 187 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP5-208ENST00000459627 MT3P25713 68 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP5-208ENST00000459627 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 MUC5ACP98088 5654 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PMAIP1Q13794 54 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.4□□□□□ -1.38
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAC1Q96KF2 57 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE1EQ5T753 118 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP5-208ENST00000459627 PRO0628Q9UI54 55 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.73□□□□□ -1.49
SH3BP5-208ENST00000459627 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE1CQ5T751 118 aa5.56□□□□□ -1.52
SH3BP5-208ENST00000459627 SVIPQ8NHG7 77 aa5.55□□□□□ -1.52
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.26□□□□□ -1.57
SH3BP5-208ENST00000459627 LUZP6Q538Z0 58 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE1FQ5T754 118 aa4.83□□□□□ -1.64
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.74□□□□□ -1.65
SH3BP5-208ENST00000459627 PHGR1C9JFL3 82 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.44□□□□□ -1.7
SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFAF8A1L188 74 aa4.24□□□□□ -1.73
SH3BP5-208ENST00000459627 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.03□□□□□ -1.76
SH3BP5-208ENST00000459627 PRM1P04553 51 aa3.97□□□□□ -1.77
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP5-208ENST00000459627 INE1O15225 51 aa3.26□□□□□ -1.89
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0A0MQY5 61 aa3.19□□□□□ -1.9
SH3BP5-208ENST00000459627 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.88□□□□□ -1.95
SH3BP5-208ENST00000459627 H3BS24 57 aa2.15□□□□□ -2.07
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