RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR15LQ9BU68 103 aa8.92□□□□□ -0.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.91□□□□□ -0.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP12-3P60328 96 aa8.84□□□□□ -0.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.83□□□□□ -1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa8.8□□□□□ -1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC179H3BU77 68 aa8.74□□□□□ -1.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.74□□□□□ -1.01
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCR11O14957 56 aa8.61□□□□□ -1.03
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa8.56□□□□□ -1.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.55□□□□□ -1.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa8.5□□□□□ -1.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.49□□□□□ -1.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP12-4P60329 112 aa8.44□□□□□ -1.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM258P61165 79 aa8.39□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.38□□□□□ -1.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.32□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 K7ERS5 55 aa8.3□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.16□□□□□ -1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.15□□□□□ -1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.11□□□□□ -1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSPHP1O15172 72 aa8.06□□□□□ -1.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 V9GYY9 64 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q1T7F1 81 aa7.94□□□□□ -1.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT1AP04731 61 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.81□□□□□ -1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A6NED7 52 aa7.78□□□□□ -1.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROMO1P60602 79 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.64□□□□□ -1.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-8O75690 187 aa7.61□□□□□ -1.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.58□□□□□ -1.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OBSCNQ5VST9 7968 aa7.46□□□□□ -1.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BS24 57 aa7.46□□□□□ -1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC5ACP98088 5654 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT3P25713 68 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.98□□□□□ -1.29
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCP4P48539 62 aa6.74□□□□□ -1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE1EQ5T753 118 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRK1Q8WUW1 75 aa6.29□□□□□ -1.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE1CQ5T751 118 aa6.23□□□□□ -1.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMAIP1Q13794 54 aa5.88□□□□□ -1.47
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SVIPQ8NHG7 77 aa5.82□□□□□ -1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.79□□□□□ -1.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAC1Q96KF2 57 aa5.77□□□□□ -1.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE1FQ5T754 118 aa5.58□□□□□ -1.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.4□□□□□ -1.54
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.19□□□□□ -1.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHGR1C9JFL3 82 aa5.16□□□□□ -1.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRO0628Q9UI54 55 aa5.07□□□□□ -1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.97□□□□□ -1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LUZP6Q538Z0 58 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0A0MQY5 61 aa4.94□□□□□ -1.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.62□□□□□ -1.67
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.92□□□□□ -1.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRM1P04553 51 aa3.9□□□□□ -1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFAF8A1L188 74 aa3.85□□□□□ -1.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC16Q8WXI7 14507 aa3.23□□□□□ -1.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INE1O15225 51 aa2.73□□□□□ -1.97
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