RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452545.1

ABCB6-206, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group), human

TSL 4

Gene ABCB6, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.61	□□□□□ -1.51
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.59	□□□□□ -1.51
ABCB6-206	ENST00000452545		A8MU10	97 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ABCB6-206	ENST00000452545		A0A1B0GU69	56 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.5	□□□□□ -1.53
ABCB6-206	ENST00000452545	COX7C	P15954	63 aa		5.49	□□□□□ -1.53
ABCB6-206	ENST00000452545	PCP4	P48539	62 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ABCB6-206	ENST00000452545	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ABCB6-206	ENST00000452545	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ABCB6-206	ENST00000452545		H7BZZ5	65 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ABCB6-206	ENST00000452545	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.34	□□□□□ -1.55
ABCB6-206	ENST00000452545	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.27	□□□□□ -1.57
ABCB6-206	ENST00000452545	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ABCB6-206	ENST00000452545	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
ABCB6-206	ENST00000452545	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
ABCB6-206	ENST00000452545	TMEM258	P61165	79 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.13	□□□□□ -1.59
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.12	□□□□□ -1.59
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ABCB6-206	ENST00000452545	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ABCB6-206	ENST00000452545	UQCR11	O14957	56 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCB6-206	ENST00000452545	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCB6-206	ENST00000452545	MT1A	P04731	61 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCB6-206	ENST00000452545	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCB6-206	ENST00000452545		K7ERS5	55 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB6-206	ENST00000452545	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB6-206	ENST00000452545	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ABCB6-206	ENST00000452545	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ABCB6-206	ENST00000452545	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ABCB6-206	ENST00000452545		Q1T7F1	81 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ABCB6-206	ENST00000452545		V9GYY9	64 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ABCB6-206	ENST00000452545	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ABCB6-206	ENST00000452545	PSPHP1	O15172	72 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
ABCB6-206	ENST00000452545	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ABCB6-206	ENST00000452545		A6NED7	52 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB6-206	ENST00000452545	MT3	P25713	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ABCB6-206	ENST00000452545	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ABCB6-206	ENST00000452545	ROMO1	P60602	79 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ABCB6-206	ENST00000452545	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ABCB6-206	ENST00000452545	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.26	□□□□□ -1.73
ABCB6-206	ENST00000452545	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ABCB6-206	ENST00000452545	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ABCB6-206	ENST00000452545	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.04	□□□□□ -1.76
ABCB6-206	ENST00000452545		H3BS24	57 aa		4.01	□□□□□ -1.77
ABCB6-206	ENST00000452545	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ABCB6-206	ENST00000452545	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ABCB6-206	ENST00000452545		A0A0A0MQY5	61 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ABCB6-206	ENST00000452545	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ABCB6-206	ENST00000452545	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
ABCB6-206	ENST00000452545	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ABCB6-206	ENST00000452545	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ABCB6-206	ENST00000452545	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.27	□□□□□ -1.89
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.25	□□□□□ -1.89
ABCB6-206	ENST00000452545	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.24	□□□□□ -1.89
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ABCB6-206	ENST00000452545	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.95	□□□□□ -1.94
ABCB6-206	ENST00000452545	INE1	O15225	51 aa		2.82	□□□□□ -1.96
ABCB6-206	ENST00000452545	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.6	□□□□□ -1.99
ABCB6-206	ENST00000452545	PRM1	P04553	51 aa		2.28	□□□□□ -2.04
ABCB6-206	ENST00000452545	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.11	□□□□□ -2.07

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 565.6 ms