RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR2AP35326 72 aa4.2□□□□□ -1.74
RPRD1B-202ENST00000449186 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.19□□□□□ -1.74
RPRD1B-202ENST00000449186 MDN1Q9NU22 5596 aa4.18□□□□□ -1.74
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.15□□□□□ -1.75
RPRD1B-202ENST00000449186 A6NED7 52 aa4.13□□□□□ -1.75
RPRD1B-202ENST00000449186 TNP1P09430 55 aa4.1□□□□□ -1.75
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.1□□□□□ -1.75
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE3AQ5TA76 89 aa4.1□□□□□ -1.75
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1EP04732 61 aa4.09□□□□□ -1.75
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.07□□□□□ -1.76
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR2DP22532 72 aa4.05□□□□□ -1.76
RPRD1B-202ENST00000449186 K7ERS5 55 aa4.02□□□□□ -1.77
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4□□□□□ -1.77
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4□□□□□ -1.77
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.98□□□□□ -1.77
RPRD1B-202ENST00000449186 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.96□□□□□ -1.78
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.94□□□□□ -1.78
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1LQ93083 61 aa3.94□□□□□ -1.78
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP12-3P60328 96 aa3.9□□□□□ -1.79
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1GP13640 62 aa3.89□□□□□ -1.79
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1MQ8N339 61 aa3.88□□□□□ -1.79
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.88□□□□□ -1.79
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.88□□□□□ -1.79
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.88□□□□□ -1.79
RPRD1B-202ENST00000449186 ROMO1P60602 79 aa3.87□□□□□ -1.79
RPRD1B-202ENST00000449186 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RPRD1B-202ENST00000449186 PP632Q6XCG6 107 aa3.8□□□□□ -1.8
RPRD1B-202ENST00000449186 SVIPQ8NHG7 77 aa3.77□□□□□ -1.81
RPRD1B-202ENST00000449186 BRK1Q8WUW1 75 aa3.77□□□□□ -1.81
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.62□□□□□ -1.83
RPRD1B-202ENST00000449186 MT4P47944 62 aa3.57□□□□□ -1.84
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.56□□□□□ -1.84
RPRD1B-202ENST00000449186 PMAIP1Q13794 54 aa3.53□□□□□ -1.84
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1B-202ENST00000449186 PRAC1Q96KF2 57 aa3.46□□□□□ -1.86
RPRD1B-202ENST00000449186 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.43□□□□□ -1.86
RPRD1B-202ENST00000449186 PRO0628Q9UI54 55 aa3.41□□□□□ -1.86
RPRD1B-202ENST00000449186 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.37□□□□□ -1.87
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.36□□□□□ -1.87
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.35□□□□□ -1.87
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1AP04731 61 aa3.33□□□□□ -1.88
RPRD1B-202ENST00000449186 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.32□□□□□ -1.88
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP12-4P60329 112 aa3.32□□□□□ -1.88
RPRD1B-202ENST00000449186 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.3□□□□□ -1.88
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE1EQ5T753 118 aa3.29□□□□□ -1.88
RPRD1B-202ENST00000449186 MT3P25713 68 aa3.26□□□□□ -1.89
RPRD1B-202ENST00000449186 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.25□□□□□ -1.89
RPRD1B-202ENST00000449186 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.22□□□□□ -1.89
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.19□□□□□ -1.9
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.16□□□□□ -1.9
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.15□□□□□ -1.91
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.01□□□□□ -1.93
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0A0MQY5 61 aa3□□□□□ -1.93
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE1FQ5T754 118 aa2.94□□□□□ -1.94
RPRD1B-202ENST00000449186 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.93□□□□□ -1.94
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-8O75690 187 aa2.92□□□□□ -1.94
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.89□□□□□ -1.95
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.77□□□□□ -1.97
RPRD1B-202ENST00000449186 LUZP6Q538Z0 58 aa2.73□□□□□ -1.97
RPRD1B-202ENST00000449186 MUC5ACP98088 5654 aa2.69□□□□□ -1.98
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.62□□□□□ -1.99
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.61□□□□□ -1.99
RPRD1B-202ENST00000449186 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
RPRD1B-202ENST00000449186 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFAF8A1L188 74 aa2.53□□□□□ -2
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE1CQ5T751 118 aa2.51□□□□□ -2.01
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.5□□□□□ -2.01
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.2□□□□□ -2.06
RPRD1B-202ENST00000449186 PRM1P04553 51 aa2.03□□□□□ -2.08
RPRD1B-202ENST00000449186 PHGR1C9JFL3 82 aa1.97□□□□□ -2.09
RPRD1B-202ENST00000449186 INE1O15225 51 aa1.9□□□□□ -2.11
RPRD1B-202ENST00000449186 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.81□□□□□ -2.12
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.35□□□□□ -2.19
RPRD1B-202ENST00000449186 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.3□□□□□ -2.2
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