RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 MT1LQ93083 61 aa5.06□□□□□ -1.6
TOP3B-206ENST00000436282 MT1EP04732 61 aa5.06□□□□□ -1.6
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.06□□□□□ -1.6
TOP3B-206ENST00000436282 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.92□□□□□ -1.62
TOP3B-206ENST00000436282 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TOP3B-206ENST00000436282 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
TOP3B-206ENST00000436282 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.87□□□□□ -1.63
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.86□□□□□ -1.63
TOP3B-206ENST00000436282 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.8□□□□□ -1.64
TOP3B-206ENST00000436282 MT1GP13640 62 aa4.76□□□□□ -1.65
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.75□□□□□ -1.65
TOP3B-206ENST00000436282 MT1MQ8N339 61 aa4.74□□□□□ -1.65
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.71□□□□□ -1.65
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP12-4P60329 112 aa4.69□□□□□ -1.66
TOP3B-206ENST00000436282 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TOP3B-206ENST00000436282 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.62□□□□□ -1.67
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TOP3B-206ENST00000436282 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.59□□□□□ -1.68
TOP3B-206ENST00000436282 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
TOP3B-206ENST00000436282 MDN1Q9NU22 5596 aa4.46□□□□□ -1.7
TOP3B-206ENST00000436282 LCE3BQ5TA77 95 aa4.45□□□□□ -1.7
TOP3B-206ENST00000436282 MT1AP04731 61 aa4.4□□□□□ -1.7
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.39□□□□□ -1.71
TOP3B-206ENST00000436282 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
TOP3B-206ENST00000436282 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.35□□□□□ -1.71
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR2EP22531 72 aa4.3□□□□□ -1.72
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR2BP35325 72 aa4.3□□□□□ -1.72
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR2AP35326 72 aa4.3□□□□□ -1.72
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.3□□□□□ -1.72
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-9P26371 169 aa4.3□□□□□ -1.72
TOP3B-206ENST00000436282 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.28□□□□□ -1.72
TOP3B-206ENST00000436282 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.26□□□□□ -1.73
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
TOP3B-206ENST00000436282 PRM1P04553 51 aa4.19□□□□□ -1.74
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.19□□□□□ -1.74
TOP3B-206ENST00000436282 NEBP20929 6669 aa4.18□□□□□ -1.74
TOP3B-206ENST00000436282 SPRR2DP22532 72 aa4.11□□□□□ -1.75
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4□□□□□ -1.77
TOP3B-206ENST00000436282 OBSCNQ5VST9 7968 aa4□□□□□ -1.77
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.99□□□□□ -1.77
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.98□□□□□ -1.77
TOP3B-206ENST00000436282 MT3P25713 68 aa3.81□□□□□ -1.8
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.74□□□□□ -1.81
TOP3B-206ENST00000436282 LCE1EQ5T753 118 aa3.73□□□□□ -1.81
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.69□□□□□ -1.82
TOP3B-206ENST00000436282 MT4P47944 62 aa3.68□□□□□ -1.82
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.66□□□□□ -1.82
TOP3B-206ENST00000436282 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.59□□□□□ -1.84
TOP3B-206ENST00000436282 LCE1DQ5T752 114 aa3.53□□□□□ -1.84
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.52□□□□□ -1.85
TOP3B-206ENST00000436282 LCE4AQ5TA78 99 aa3.5□□□□□ -1.85
TOP3B-206ENST00000436282 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.45□□□□□ -1.86
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.42□□□□□ -1.86
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.32□□□□□ -1.88
TOP3B-206ENST00000436282 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.27□□□□□ -1.89
TOP3B-206ENST00000436282 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.26□□□□□ -1.89
TOP3B-206ENST00000436282 LCE1FQ5T754 118 aa3.25□□□□□ -1.89
TOP3B-206ENST00000436282 MUC5ACP98088 5654 aa3.22□□□□□ -1.89
TOP3B-206ENST00000436282 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.19□□□□□ -1.9
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.15□□□□□ -1.91
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.12□□□□□ -1.91
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.04□□□□□ -1.92
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.03□□□□□ -1.92
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.97□□□□□ -1.93
TOP3B-206ENST00000436282 LCE1CQ5T751 118 aa2.92□□□□□ -1.94
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-8O75690 187 aa2.79□□□□□ -1.96
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.76□□□□□ -1.97
TOP3B-206ENST00000436282 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TOP3B-206ENST00000436282 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.68□□□□□ -1.98
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.62□□□□□ -1.99
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.54□□□□□ -2
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.53□□□□□ -2
TOP3B-206ENST00000436282 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.52□□□□□ -2.01
TOP3B-206ENST00000436282 PHGR1C9JFL3 82 aa2.19□□□□□ -2.06
TOP3B-206ENST00000436282 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.46□□□□□ -2.18
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