RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-9P26371 169 aa6.79□□□□□ -1.32
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP2-202ENST00000435136 MDN1Q9NU22 5596 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1EP04732 61 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 NEBP20929 6669 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1LQ93083 61 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SPRR2EP22531 72 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 SPRR2BP35325 72 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 SPRR2AP35326 72 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0A0MQY5 61 aa6.44□□□□□ -1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.38□□□□□ -1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.34□□□□□ -1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1GP13640 62 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-202ENST00000435136 SPRR2DP22532 72 aa6.26□□□□□ -1.41
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1MQ8N339 61 aa6.24□□□□□ -1.41
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.1□□□□□ -1.43
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE3BQ5TA77 95 aa6.09□□□□□ -1.43
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP2-202ENST00000435136 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SH3BP2-202ENST00000435136 INE1O15225 51 aa6.01□□□□□ -1.45
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.69□□□□□ -1.5
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1AP04731 61 aa5.61□□□□□ -1.51
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE1DQ5T752 114 aa5.53□□□□□ -1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 MT4P47944 62 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE4AQ5TA78 99 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.5□□□□□ -1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.29□□□□□ -1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP12-4P60329 112 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.14□□□□□ -1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.11□□□□□ -1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.09□□□□□ -1.6
SH3BP2-202ENST00000435136 MT3P25713 68 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.02□□□□□ -1.61
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.75□□□□□ -1.65
SH3BP2-202ENST00000435136 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.71□□□□□ -1.65
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.68□□□□□ -1.66
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-8O75690 187 aa4.54□□□□□ -1.68
SH3BP2-202ENST00000435136 PRM1P04553 51 aa4.52□□□□□ -1.69
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE1EQ5T753 118 aa4.34□□□□□ -1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.34□□□□□ -1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.21□□□□□ -1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC5ACP98088 5654 aa4.19□□□□□ -1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE1CQ5T751 118 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.99□□□□□ -1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.62□□□□□ -1.83
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.53□□□□□ -1.84
SH3BP2-202ENST00000435136 LCE1FQ5T754 118 aa3.32□□□□□ -1.88
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.11□□□□□ -1.91
SH3BP2-202ENST00000435136 PHGR1C9JFL3 82 aa3.03□□□□□ -1.92
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.87□□□□□ -1.95
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.87□□□□□ -1.95
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.02□□□□□ -2.09
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