RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434353.6

CXorf40A-208, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-208ENST00000434353 MDN1Q9NU22 5596 aa6.98□□□□□ -1.29
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CXorf40A-208ENST00000434353 NEBP20929 6669 aa6.95□□□□□ -1.3
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP12-3P60328 96 aa6.84□□□□□ -1.31
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.81□□□□□ -1.32
CXorf40A-208ENST00000434353 SPRR2DP22532 72 aa6.79□□□□□ -1.32
CXorf40A-208ENST00000434353 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.75□□□□□ -1.33
CXorf40A-208ENST00000434353 MT1LQ93083 61 aa6.75□□□□□ -1.33
CXorf40A-208ENST00000434353 H3BS24 57 aa6.74□□□□□ -1.33
CXorf40A-208ENST00000434353 MT1GP13640 62 aa6.69□□□□□ -1.34
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.69□□□□□ -1.34
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.63□□□□□ -1.35
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.63□□□□□ -1.35
CXorf40A-208ENST00000434353 MT1MQ8N339 61 aa6.6□□□□□ -1.35
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CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.55□□□□□ -1.36
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CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.46□□□□□ -1.37
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.45□□□□□ -1.38
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.45□□□□□ -1.38
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.4□□□□□ -1.38
CXorf40A-208ENST00000434353 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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CXorf40A-208ENST00000434353 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.28□□□□□ -1.4
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CXorf40A-208ENST00000434353 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.11□□□□□ -1.43
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CXorf40A-208ENST00000434353 LCE4AQ5TA78 99 aa5.99□□□□□ -1.45
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.99□□□□□ -1.45
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.98□□□□□ -1.45
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.98□□□□□ -1.45
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CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.79□□□□□ -1.48
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CXorf40A-208ENST00000434353 A0A0A0MQY5 61 aa5.71□□□□□ -1.5
CXorf40A-208ENST00000434353 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.7□□□□□ -1.5
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CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.64□□□□□ -1.51
CXorf40A-208ENST00000434353 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.49□□□□□ -1.53
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.43□□□□□ -1.54
CXorf40A-208ENST00000434353 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.43□□□□□ -1.54
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.34□□□□□ -1.55
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.33□□□□□ -1.56
CXorf40A-208ENST00000434353 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.3□□□□□ -1.56
CXorf40A-208ENST00000434353 MT3P25713 68 aa5.23□□□□□ -1.57
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.2□□□□□ -1.58
CXorf40A-208ENST00000434353 INE1O15225 51 aa5.03□□□□□ -1.6
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.02□□□□□ -1.61
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.92□□□□□ -1.62
CXorf40A-208ENST00000434353 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.88□□□□□ -1.63
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-8O75690 187 aa4.83□□□□□ -1.64
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.69□□□□□ -1.66
CXorf40A-208ENST00000434353 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.67□□□□□ -1.66
CXorf40A-208ENST00000434353 LCE1EQ5T753 118 aa4.66□□□□□ -1.66
CXorf40A-208ENST00000434353 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.51□□□□□ -1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.5□□□□□ -1.69
CXorf40A-208ENST00000434353 MUC5ACP98088 5654 aa4.45□□□□□ -1.7
CXorf40A-208ENST00000434353 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.41□□□□□ -1.7
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.37□□□□□ -1.71
CXorf40A-208ENST00000434353 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
CXorf40A-208ENST00000434353 LCE1CQ5T751 118 aa4.33□□□□□ -1.72
CXorf40A-208ENST00000434353 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CXorf40A-208ENST00000434353 PRM1P04553 51 aa3.95□□□□□ -1.78
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.88□□□□□ -1.79
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.82□□□□□ -1.8
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.73□□□□□ -1.81
CXorf40A-208ENST00000434353 LCE1FQ5T754 118 aa3.63□□□□□ -1.83
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.38□□□□□ -1.87
CXorf40A-208ENST00000434353 PHGR1C9JFL3 82 aa3.34□□□□□ -1.88
CXorf40A-208ENST00000434353 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.94□□□□□ -1.94
CXorf40A-208ENST00000434353 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.46□□□□□ -2.02
CXorf40A-208ENST00000434353 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.08□□□□□ -2.08
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