RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-206ENST00000431413 CCDC179H3BU77 68 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GU69 56 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-206ENST00000431413 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
HERC3-206ENST00000431413 A8MU10 97 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC3-206ENST00000431413 TNP1P09430 55 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC3-206ENST00000431413 MT1MQ8N339 61 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC3-206ENST00000431413 MT1LQ93083 61 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC3-206ENST00000431413 TMEM258P61165 79 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC3-206ENST00000431413 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.34□□□□□ -1.55
HERC3-206ENST00000431413 LCE3AQ5TA76 89 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC3-206ENST00000431413 PRR15LQ9BU68 103 aa5.32□□□□□ -1.56
HERC3-206ENST00000431413 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.3□□□□□ -1.56
HERC3-206ENST00000431413 MT4P47944 62 aa5.3□□□□□ -1.56
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.23□□□□□ -1.57
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC3-206ENST00000431413 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP12-3P60328 96 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-206ENST00000431413 PCP4P48539 62 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-206ENST00000431413 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-206ENST00000431413 UQCR11O14957 56 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-206ENST00000431413 V9GYY9 64 aa5.08□□□□□ -1.6
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.04□□□□□ -1.6
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-206ENST00000431413 K7ERS5 55 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-206ENST00000431413 Q1T7F1 81 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-206ENST00000431413 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-206ENST00000431413 PSPHP1O15172 72 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-206ENST00000431413 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
HERC3-206ENST00000431413 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP12-4P60329 112 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.87□□□□□ -1.63
HERC3-206ENST00000431413 A6NED7 52 aa4.85□□□□□ -1.63
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.82□□□□□ -1.64
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.78□□□□□ -1.64
HERC3-206ENST00000431413 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC3-206ENST00000431413 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.73□□□□□ -1.65
HERC3-206ENST00000431413 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.65□□□□□ -1.67
HERC3-206ENST00000431413 MT1AP04731 61 aa4.59□□□□□ -1.67
HERC3-206ENST00000431413 ROMO1P60602 79 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC3-206ENST00000431413 BRK1Q8WUW1 75 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.4□□□□□ -1.71
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.38□□□□□ -1.71
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-8O75690 187 aa4.37□□□□□ -1.71
HERC3-206ENST00000431413 SVIPQ8NHG7 77 aa4.34□□□□□ -1.71
HERC3-206ENST00000431413 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.31□□□□□ -1.72
HERC3-206ENST00000431413 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
HERC3-206ENST00000431413 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
HERC3-206ENST00000431413 MUC5ACP98088 5654 aa4.27□□□□□ -1.73
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
HERC3-206ENST00000431413 MT3P25713 68 aa4.23□□□□□ -1.73
HERC3-206ENST00000431413 PMAIP1Q13794 54 aa4.2□□□□□ -1.74
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.17□□□□□ -1.74
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.08□□□□□ -1.76
HERC3-206ENST00000431413 PRO0628Q9UI54 55 aa4.07□□□□□ -1.76
HERC3-206ENST00000431413 PRAC1Q96KF2 57 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-206ENST00000431413 LCE1EQ5T753 118 aa3.91□□□□□ -1.78
HERC3-206ENST00000431413 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC3-206ENST00000431413 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.68□□□□□ -1.82
HERC3-206ENST00000431413 LCE1CQ5T751 118 aa3.62□□□□□ -1.83
HERC3-206ENST00000431413 A0A0A0MQY5 61 aa3.57□□□□□ -1.84
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC3-206ENST00000431413 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.41□□□□□ -1.86
HERC3-206ENST00000431413 LUZP6Q538Z0 58 aa3.4□□□□□ -1.87
HERC3-206ENST00000431413 LCE1FQ5T754 118 aa3.25□□□□□ -1.89
HERC3-206ENST00000431413 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.18□□□□□ -1.9
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-206ENST00000431413 PHGR1C9JFL3 82 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-206ENST00000431413 NDUFAF8A1L188 74 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-206ENST00000431413 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-206ENST00000431413 INE1O15225 51 aa2.41□□□□□ -2.02
HERC3-206ENST00000431413 PRM1P04553 51 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.27□□□□□ -2.05
HERC3-206ENST00000431413 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.84□□□□□ -2.11
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