RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431381.5

CITED1-206, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CITED1, Length 941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-206ENST00000431381 KMT2DO14686 5537 aa4.95□□□□□ -1.62
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.91□□□□□ -1.62
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP12-3P60328 96 aa4.89□□□□□ -1.63
CITED1-206ENST00000431381 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CITED1-206ENST00000431381 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.86□□□□□ -1.63
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.83□□□□□ -1.64
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.82□□□□□ -1.64
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.82□□□□□ -1.64
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.8□□□□□ -1.64
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CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-9P26371 169 aa4.77□□□□□ -1.65
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.77□□□□□ -1.65
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CITED1-206ENST00000431381 SPRR2AP35326 72 aa4.67□□□□□ -1.66
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CITED1-206ENST00000431381 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.66□□□□□ -1.66
CITED1-206ENST00000431381 MT1GP13640 62 aa4.6□□□□□ -1.67
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CITED1-206ENST00000431381 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.6□□□□□ -1.67
CITED1-206ENST00000431381 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.55□□□□□ -1.68
CITED1-206ENST00000431381 MT1MQ8N339 61 aa4.53□□□□□ -1.68
CITED1-206ENST00000431381 SPRR2DP22532 72 aa4.5□□□□□ -1.69
CITED1-206ENST00000431381 MDN1Q9NU22 5596 aa4.47□□□□□ -1.69
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.42□□□□□ -1.7
CITED1-206ENST00000431381 NEBP20929 6669 aa4.4□□□□□ -1.7
CITED1-206ENST00000431381 A0A0A0MQY5 61 aa4.39□□□□□ -1.71
CITED1-206ENST00000431381 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.33□□□□□ -1.72
CITED1-206ENST00000431381 LUZP6Q538Z0 58 aa4.28□□□□□ -1.72
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.26□□□□□ -1.73
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.26□□□□□ -1.73
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.24□□□□□ -1.73
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.22□□□□□ -1.73
CITED1-206ENST00000431381 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.15□□□□□ -1.75
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.15□□□□□ -1.75
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4□□□□□ -1.77
CITED1-206ENST00000431381 NDUFAF8A1L188 74 aa3.99□□□□□ -1.77
CITED1-206ENST00000431381 MT1AP04731 61 aa3.99□□□□□ -1.77
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.94□□□□□ -1.78
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.94□□□□□ -1.78
CITED1-206ENST00000431381 MT4P47944 62 aa3.91□□□□□ -1.78
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP12-4P60329 112 aa3.9□□□□□ -1.79
CITED1-206ENST00000431381 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.72□□□□□ -1.81
CITED1-206ENST00000431381 MT3P25713 68 aa3.71□□□□□ -1.82
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.66□□□□□ -1.82
CITED1-206ENST00000431381 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.62□□□□□ -1.83
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.53□□□□□ -1.84
CITED1-206ENST00000431381 LCE1FQ5T754 118 aa3.42□□□□□ -1.86
CITED1-206ENST00000431381 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.41□□□□□ -1.86
CITED1-206ENST00000431381 LCE1EQ5T753 118 aa3.32□□□□□ -1.88
CITED1-206ENST00000431381 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.31□□□□□ -1.88
CITED1-206ENST00000431381 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.31□□□□□ -1.88
CITED1-206ENST00000431381 INE1O15225 51 aa3.3□□□□□ -1.88
CITED1-206ENST00000431381 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.3□□□□□ -1.88
CITED1-206ENST00000431381 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.27□□□□□ -1.89
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.25□□□□□ -1.89
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.23□□□□□ -1.89
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-8O75690 187 aa3.12□□□□□ -1.91
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.08□□□□□ -1.92
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
CITED1-206ENST00000431381 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.03□□□□□ -1.92
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.02□□□□□ -1.93
CITED1-206ENST00000431381 LCE1CQ5T751 118 aa2.94□□□□□ -1.94
CITED1-206ENST00000431381 MUC5ACP98088 5654 aa2.91□□□□□ -1.94
CITED1-206ENST00000431381 PRM1P04553 51 aa2.81□□□□□ -1.96
CITED1-206ENST00000431381 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.57□□□□□ -2
CITED1-206ENST00000431381 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.55□□□□□ -2
CITED1-206ENST00000431381 PHGR1C9JFL3 82 aa2.24□□□□□ -2.05
CITED1-206ENST00000431381 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.93□□□□□ -2.1
CITED1-206ENST00000431381 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.64□□□□□ -2.15
CITED1-206ENST00000431381 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms