RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
ATG4B-210ENST00000428861 Q1T7F1 81 aa3.79□□□□□ -1.8
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.76□□□□□ -1.81
ATG4B-210ENST00000428861 V9GYY9 64 aa3.76□□□□□ -1.81
ATG4B-210ENST00000428861 PP632Q6XCG6 107 aa3.75□□□□□ -1.81
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP12-3P60328 96 aa3.73□□□□□ -1.81
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.72□□□□□ -1.81
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.7□□□□□ -1.82
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.68□□□□□ -1.82
ATG4B-210ENST00000428861 K7ERS5 55 aa3.66□□□□□ -1.82
ATG4B-210ENST00000428861 A6NED7 52 aa3.64□□□□□ -1.83
ATG4B-210ENST00000428861 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
ATG4B-210ENST00000428861 LCE1DQ5T752 114 aa3.62□□□□□ -1.83
ATG4B-210ENST00000428861 LCE4AQ5TA78 99 aa3.6□□□□□ -1.83
ATG4B-210ENST00000428861 MT4P47944 62 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG4B-210ENST00000428861 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.53□□□□□ -1.84
ATG4B-210ENST00000428861 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.52□□□□□ -1.85
ATG4B-210ENST00000428861 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.5□□□□□ -1.85
ATG4B-210ENST00000428861 ROMO1P60602 79 aa3.5□□□□□ -1.85
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.5□□□□□ -1.85
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ATG4B-210ENST00000428861 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.49□□□□□ -1.85
ATG4B-210ENST00000428861 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG4B-210ENST00000428861 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG4B-210ENST00000428861 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATG4B-210ENST00000428861 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.34□□□□□ -1.87
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP12-4P60329 112 aa3.32□□□□□ -1.88
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.31□□□□□ -1.88
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.3□□□□□ -1.88
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.26□□□□□ -1.89
ATG4B-210ENST00000428861 MT1AP04731 61 aa3.25□□□□□ -1.89
ATG4B-210ENST00000428861 BRK1Q8WUW1 75 aa3.19□□□□□ -1.9
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.18□□□□□ -1.9
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.16□□□□□ -1.9
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.14□□□□□ -1.91
ATG4B-210ENST00000428861 PRO0628Q9UI54 55 aa3.11□□□□□ -1.91
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.09□□□□□ -1.91
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.06□□□□□ -1.92
ATG4B-210ENST00000428861 SVIPQ8NHG7 77 aa3.02□□□□□ -1.93
ATG4B-210ENST00000428861 PMAIP1Q13794 54 aa3.01□□□□□ -1.93
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-8O75690 187 aa2.98□□□□□ -1.93
ATG4B-210ENST00000428861 MT3P25713 68 aa2.95□□□□□ -1.94
ATG4B-210ENST00000428861 PRAC1Q96KF2 57 aa2.95□□□□□ -1.94
ATG4B-210ENST00000428861 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.87□□□□□ -1.95
ATG4B-210ENST00000428861 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.87□□□□□ -1.95
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.83□□□□□ -1.96
ATG4B-210ENST00000428861 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
ATG4B-210ENST00000428861 MUC5ACP98088 5654 aa2.77□□□□□ -1.97
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.76□□□□□ -1.97
ATG4B-210ENST00000428861 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.97
ATG4B-210ENST00000428861 LCE1EQ5T753 118 aa2.68□□□□□ -1.98
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.59□□□□□ -1.99
ATG4B-210ENST00000428861 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.55□□□□□ -2
ATG4B-210ENST00000428861 LCE1CQ5T751 118 aa2.5□□□□□ -2.01
ATG4B-210ENST00000428861 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.47□□□□□ -2.01
ATG4B-210ENST00000428861 LUZP6Q538Z0 58 aa2.37□□□□□ -2.03
ATG4B-210ENST00000428861 H3BS24 57 aa2.35□□□□□ -2.03
ATG4B-210ENST00000428861 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.34□□□□□ -2.03
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.32□□□□□ -2.04
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.26□□□□□ -2.05
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFAF8A1L188 74 aa2.22□□□□□ -2.05
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.16□□□□□ -2.06
ATG4B-210ENST00000428861 LCE1FQ5T754 118 aa2.16□□□□□ -2.06
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0A0MQY5 61 aa2.03□□□□□ -2.08
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.98□□□□□ -2.09
ATG4B-210ENST00000428861 PHGR1C9JFL3 82 aa1.96□□□□□ -2.1
ATG4B-210ENST00000428861 INE1O15225 51 aa1.89□□□□□ -2.11
ATG4B-210ENST00000428861 PRM1P04553 51 aa1.82□□□□□ -2.12
ATG4B-210ENST00000428861 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.78□□□□□ -2.13
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.43□□□□□ -2.18
ATG4B-210ENST00000428861 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.24□□□□□ -2.21
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 1155 ms