RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.56	□□□□□ -1.84
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.45	□□□□□ -1.86
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.38	□□□□□ -1.87
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1L	Q93083	61 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1E	P04732	61 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEB	P20929	6669 aa		3.27	□□□□□ -1.89
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.24	□□□□□ -1.89
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.23	□□□□□ -1.89
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.23	□□□□□ -1.89
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRM1	P04553	51 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1G	P13640	62 aa		3.19	□□□□□ -1.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.18	□□□□□ -1.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.17	□□□□□ -1.9
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.15	□□□□□ -1.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRR2E	P22531	72 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRR2B	P35325	72 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRR2A	P35326	72 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1M	Q8N339	61 aa		3.1	□□□□□ -1.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.09	□□□□□ -1.92
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPRR2D	P22532	72 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.04	□□□□□ -1.92
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT1A	P04731	61 aa		3.03	□□□□□ -1.92
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE1E	Q5T753	118 aa		3	□□□□□ -1.93
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.91	□□□□□ -1.94
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE1D	Q5T752	114 aa		2.89	□□□□□ -1.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		2.88	□□□□□ -1.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.85	□□□□□ -1.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.84	□□□□□ -1.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.82	□□□□□ -1.96
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT4	P47944	62 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.56	□□□□□ -2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.55	□□□□□ -2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.54	□□□□□ -2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.54	□□□□□ -2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.53	□□□□□ -2
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.52	□□□□□ -2.01
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.5	□□□□□ -2.01
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.5	□□□□□ -2.01
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.49	□□□□□ -2.01
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.48	□□□□□ -2.01
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MT3	P25713	68 aa		2.47	□□□□□ -2.01
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.38	□□□□□ -2.03
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.25	□□□□□ -2.05
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.22	□□□□□ -2.05
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.16	□□□□□ -2.06
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.11	□□□□□ -2.07
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.07	□□□□□ -2.08
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.04	□□□□□ -2.08
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.04	□□□□□ -2.08
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	1.93	□□□□□ -2.1
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		1.82	□□□□□ -2.12
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.8	□□□□□ -2.12
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.76	□□□□□ -2.13
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.56	□□□□□ -2.16
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.05	□□□□□ -2.24

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