RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.14□□□□□ -1.27
UBXN4-204ENST00000426921 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.07□□□□□ -1.28
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.07□□□□□ -1.28
UBXN4-204ENST00000426921 PRR15LQ9BU68 103 aa7.06□□□□□ -1.28
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.03□□□□□ -1.28
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP12-3P60328 96 aa7.02□□□□□ -1.29
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7□□□□□ -1.29
UBXN4-204ENST00000426921 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
UBXN4-204ENST00000426921 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.97□□□□□ -1.29
UBXN4-204ENST00000426921 CCDC179H3BU77 68 aa6.96□□□□□ -1.3
UBXN4-204ENST00000426921 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.89□□□□□ -1.31
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
UBXN4-204ENST00000426921 UQCR11O14957 56 aa6.84□□□□□ -1.31
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.82□□□□□ -1.32
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.8□□□□□ -1.32
UBXN4-204ENST00000426921 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.78□□□□□ -1.32
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.77□□□□□ -1.33
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM258P61165 79 aa6.71□□□□□ -1.34
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP12-4P60329 112 aa6.69□□□□□ -1.34
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.67□□□□□ -1.34
UBXN4-204ENST00000426921 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.64□□□□□ -1.35
UBXN4-204ENST00000426921 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
UBXN4-204ENST00000426921 K7ERS5 55 aa6.55□□□□□ -1.36
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.53□□□□□ -1.36
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.49□□□□□ -1.37
UBXN4-204ENST00000426921 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.44□□□□□ -1.38
UBXN4-204ENST00000426921 V9GYY9 64 aa6.39□□□□□ -1.39
UBXN4-204ENST00000426921 PSPHP1O15172 72 aa6.37□□□□□ -1.39
UBXN4-204ENST00000426921 Q1T7F1 81 aa6.34□□□□□ -1.39
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.32□□□□□ -1.4
UBXN4-204ENST00000426921 MT1AP04731 61 aa6.3□□□□□ -1.4
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.27□□□□□ -1.41
UBXN4-204ENST00000426921 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.19□□□□□ -1.42
UBXN4-204ENST00000426921 A6NED7 52 aa6.15□□□□□ -1.42
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.11□□□□□ -1.43
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.1□□□□□ -1.43
UBXN4-204ENST00000426921 ROMO1P60602 79 aa6.08□□□□□ -1.44
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-8O75690 187 aa6.07□□□□□ -1.44
UBXN4-204ENST00000426921 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.02□□□□□ -1.45
UBXN4-204ENST00000426921 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.93□□□□□ -1.46
UBXN4-204ENST00000426921 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
UBXN4-204ENST00000426921 MUC5ACP98088 5654 aa5.91□□□□□ -1.46
UBXN4-204ENST00000426921 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
UBXN4-204ENST00000426921 MT3P25713 68 aa5.76□□□□□ -1.49
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.76□□□□□ -1.49
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.69□□□□□ -1.5
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.65□□□□□ -1.5
UBXN4-204ENST00000426921 LCE1EQ5T753 118 aa5.38□□□□□ -1.55
UBXN4-204ENST00000426921 PCP4P48539 62 aa5.37□□□□□ -1.55
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.35□□□□□ -1.55
UBXN4-204ENST00000426921 LCE1BQ5T7P3 118 aa5□□□□□ -1.61
UBXN4-204ENST00000426921 LCE1CQ5T751 118 aa4.99□□□□□ -1.61
UBXN4-204ENST00000426921 BRK1Q8WUW1 75 aa4.97□□□□□ -1.61
UBXN4-204ENST00000426921 H3BS24 57 aa4.66□□□□□ -1.66
UBXN4-204ENST00000426921 PMAIP1Q13794 54 aa4.65□□□□□ -1.67
UBXN4-204ENST00000426921 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.59□□□□□ -1.67
UBXN4-204ENST00000426921 PRAC1Q96KF2 57 aa4.56□□□□□ -1.68
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.55□□□□□ -1.68
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
UBXN4-204ENST00000426921 LCE1FQ5T754 118 aa4.47□□□□□ -1.69
UBXN4-204ENST00000426921 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.28□□□□□ -1.72
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.16□□□□□ -1.74
UBXN4-204ENST00000426921 PHGR1C9JFL3 82 aa4.06□□□□□ -1.76
UBXN4-204ENST00000426921 PRO0628Q9UI54 55 aa4.06□□□□□ -1.76
UBXN4-204ENST00000426921 SVIPQ8NHG7 77 aa4.05□□□□□ -1.76
UBXN4-204ENST00000426921 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.98□□□□□ -1.77
UBXN4-204ENST00000426921 LUZP6Q538Z0 58 aa3.9□□□□□ -1.79
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.77□□□□□ -1.81
UBXN4-204ENST00000426921 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.68□□□□□ -1.82
UBXN4-204ENST00000426921 A0A0A0MQY5 61 aa3.39□□□□□ -1.87
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.11□□□□□ -1.91
UBXN4-204ENST00000426921 PRM1P04553 51 aa3.08□□□□□ -1.92
UBXN4-204ENST00000426921 NDUFAF8A1L188 74 aa2.8□□□□□ -1.96
UBXN4-204ENST00000426921 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.57□□□□□ -2
UBXN4-204ENST00000426921 INE1O15225 51 aa2.19□□□□□ -2.06
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