RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR2BP35325 72 aa6.05□□□□□ -1.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR2AP35326 72 aa6.05□□□□□ -1.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.05□□□□□ -1.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.01□□□□□ -1.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6□□□□□ -1.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1GP13640 62 aa5.99□□□□□ -1.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 SVIPQ8NHG7 77 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 MDN1Q9NU22 5596 aa5.98□□□□□ -1.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.97□□□□□ -1.45
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1MQ8N339 61 aa5.87□□□□□ -1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 NEBP20929 6669 aa5.85□□□□□ -1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR2DP22532 72 aa5.84□□□□□ -1.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.83□□□□□ -1.48
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.77□□□□□ -1.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.68□□□□□ -1.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE3BQ5TA77 95 aa5.63□□□□□ -1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.62□□□□□ -1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.62□□□□□ -1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.62□□□□□ -1.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.55□□□□□ -1.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.49□□□□□ -1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.49□□□□□ -1.53
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.45□□□□□ -1.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.42□□□□□ -1.54
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TOP3BP1-201ENST00000420768 LUZP6Q538Z0 58 aa5.24□□□□□ -1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.24□□□□□ -1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE4AQ5TA78 99 aa5.22□□□□□ -1.57
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT1AP04731 61 aa5.16□□□□□ -1.58
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.08□□□□□ -1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP12-4P60329 112 aa5.05□□□□□ -1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT4P47944 62 aa5.04□□□□□ -1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.04□□□□□ -1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE1DQ5T752 114 aa5.03□□□□□ -1.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.97□□□□□ -1.61
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.92□□□□□ -1.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.9□□□□□ -1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFAF8A1L188 74 aa4.85□□□□□ -1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.84□□□□□ -1.63
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.74□□□□□ -1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.73□□□□□ -1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.72□□□□□ -1.65
TOP3BP1-201ENST00000420768 MT3P25713 68 aa4.71□□□□□ -1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.69□□□□□ -1.66
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.4□□□□□ -1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.38□□□□□ -1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.34□□□□□ -1.71
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.31□□□□□ -1.72
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.27□□□□□ -1.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0A0MQY5 61 aa4.24□□□□□ -1.73
TOP3BP1-201ENST00000420768 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.21□□□□□ -1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.18□□□□□ -1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE1EQ5T753 118 aa4.18□□□□□ -1.74
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-8O75690 187 aa4.14□□□□□ -1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.09□□□□□ -1.75
TOP3BP1-201ENST00000420768 INE1O15225 51 aa4.05□□□□□ -1.76
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE1CQ5T751 118 aa3.88□□□□□ -1.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.88□□□□□ -1.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.86□□□□□ -1.79
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC5ACP98088 5654 aa3.84□□□□□ -1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.83□□□□□ -1.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BS24 57 aa3.7□□□□□ -1.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRM1P04553 51 aa3.49□□□□□ -1.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.44□□□□□ -1.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.35□□□□□ -1.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.24□□□□□ -1.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 LCE1FQ5T754 118 aa3.22□□□□□ -1.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 PHGR1C9JFL3 82 aa2.96□□□□□ -1.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.94□□□□□ -1.94
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.54□□□□□ -2
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.1□□□□□ -2.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 163 ms