RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MT1GP13640 62 aa4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A6NED7 52 aa4.41□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.41□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MT1LQ93083 61 aa4.41□□□□□ -1.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SVIPQ8NHG7 77 aa4.4□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MT1MQ8N339 61 aa4.38□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PCP4P48539 62 aa4.37□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP12-3P60328 96 aa4.37□□□□□ -1.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.25□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.23□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCE4AQ5TA78 99 aa4.22□□□□□ -1.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ROMO1P60602 79 aa4.18□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.18□□□□□ -1.74
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.17□□□□□ -1.74
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.12□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.09□□□□□ -1.75
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.08□□□□□ -1.76
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4□□□□□ -1.77
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.96□□□□□ -1.78
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP12-4P60329 112 aa3.95□□□□□ -1.78
TTC28-AS1-203ENST00000419253 H3BS24 57 aa3.9□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.89□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.89□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.88□□□□□ -1.79
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BRK1Q8WUW1 75 aa3.87□□□□□ -1.79
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.79□□□□□ -1.8
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MT1AP04731 61 aa3.77□□□□□ -1.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.75□□□□□ -1.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.72□□□□□ -1.81
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.72□□□□□ -1.81
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.65□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.64□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.59□□□□□ -1.83
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.56□□□□□ -1.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.53□□□□□ -1.84
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MT3P25713 68 aa3.48□□□□□ -1.85
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRAC1Q96KF2 57 aa3.44□□□□□ -1.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.43□□□□□ -1.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRO0628Q9UI54 55 aa3.41□□□□□ -1.86
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP5-8O75690 187 aa3.38□□□□□ -1.87
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.27□□□□□ -1.89
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.25□□□□□ -1.89
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.99□□□□□ -1.93
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.92□□□□□ -1.94
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCE1CQ5T751 118 aa2.91□□□□□ -1.94
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.78□□□□□ -1.96
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.71□□□□□ -1.98
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TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.62□□□□□ -1.99
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LCE1FQ5T754 118 aa2.56□□□□□ -2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NDUFAF8A1L188 74 aa2.47□□□□□ -2.01
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.43□□□□□ -2.02
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PHGR1C9JFL3 82 aa2.26□□□□□ -2.05
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.25□□□□□ -2.05
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRM1P04553 51 aa2.13□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.09□□□□□ -2.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 INE1O15225 51 aa1.97□□□□□ -2.09
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.71□□□□□ -2.14
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.45□□□□□ -2.18
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