RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.56□□□□□ -1.68
PRAME-201ENST00000398741 MT1LQ93083 61 aa4.53□□□□□ -1.68
PRAME-201ENST00000398741 MT1EP04732 61 aa4.53□□□□□ -1.68
PRAME-201ENST00000398741 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.47□□□□□ -1.69
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.47□□□□□ -1.69
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.47□□□□□ -1.69
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.35□□□□□ -1.71
PRAME-201ENST00000398741 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.32□□□□□ -1.72
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.26□□□□□ -1.73
PRAME-201ENST00000398741 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.25□□□□□ -1.73
PRAME-201ENST00000398741 MT1GP13640 62 aa4.25□□□□□ -1.73
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.24□□□□□ -1.73
PRAME-201ENST00000398741 MDN1Q9NU22 5596 aa4.24□□□□□ -1.73
PRAME-201ENST00000398741 MT1MQ8N339 61 aa4.23□□□□□ -1.73
PRAME-201ENST00000398741 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.22□□□□□ -1.73
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.19□□□□□ -1.74
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-9P26371 169 aa4.17□□□□□ -1.74
PRAME-201ENST00000398741 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.07□□□□□ -1.76
PRAME-201ENST00000398741 NEBP20929 6669 aa4.05□□□□□ -1.76
PRAME-201ENST00000398741 SPRR2EP22531 72 aa4.04□□□□□ -1.76
PRAME-201ENST00000398741 SPRR2BP35325 72 aa4.04□□□□□ -1.76
PRAME-201ENST00000398741 SPRR2AP35326 72 aa4.04□□□□□ -1.76
PRAME-201ENST00000398741 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.04□□□□□ -1.76
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP12-4P60329 112 aa3.98□□□□□ -1.77
PRAME-201ENST00000398741 LCE3BQ5TA77 95 aa3.94□□□□□ -1.78
PRAME-201ENST00000398741 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PRAME-201ENST00000398741 SPRR2DP22532 72 aa3.89□□□□□ -1.79
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.84□□□□□ -1.79
PRAME-201ENST00000398741 MT1AP04731 61 aa3.82□□□□□ -1.8
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.82□□□□□ -1.8
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.8□□□□□ -1.8
PRAME-201ENST00000398741 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PRAME-201ENST00000398741 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.73□□□□□ -1.81
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PRAME-201ENST00000398741 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.68□□□□□ -1.82
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.63□□□□□ -1.83
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.59□□□□□ -1.84
PRAME-201ENST00000398741 PRM1P04553 51 aa3.52□□□□□ -1.85
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.49□□□□□ -1.85
PRAME-201ENST00000398741 MT3P25713 68 aa3.44□□□□□ -1.86
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.44□□□□□ -1.86
PRAME-201ENST00000398741 MT4P47944 62 aa3.43□□□□□ -1.86
PRAME-201ENST00000398741 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.41□□□□□ -1.86
PRAME-201ENST00000398741 LCE4AQ5TA78 99 aa3.4□□□□□ -1.87
PRAME-201ENST00000398741 LCE1DQ5T752 114 aa3.38□□□□□ -1.87
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.36□□□□□ -1.87
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.26□□□□□ -1.89
PRAME-201ENST00000398741 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.24□□□□□ -1.89
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.16□□□□□ -1.9
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.15□□□□□ -1.9
PRAME-201ENST00000398741 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.15□□□□□ -1.91
PRAME-201ENST00000398741 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.14□□□□□ -1.91
PRAME-201ENST00000398741 LCE1EQ5T753 118 aa3.02□□□□□ -1.93
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.97□□□□□ -1.93
PRAME-201ENST00000398741 LCE1FQ5T754 118 aa2.96□□□□□ -1.94
PRAME-201ENST00000398741 MUC5ACP98088 5654 aa2.89□□□□□ -1.95
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.87□□□□□ -1.95
PRAME-201ENST00000398741 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.78□□□□□ -1.96
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.77□□□□□ -1.97
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-8O75690 187 aa2.75□□□□□ -1.97
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.75□□□□□ -1.97
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.64□□□□□ -1.99
PRAME-201ENST00000398741 LCE1CQ5T751 118 aa2.63□□□□□ -1.99
PRAME-201ENST00000398741 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.57□□□□□ -2
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.54□□□□□ -2
PRAME-201ENST00000398741 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.46□□□□□ -2.01
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.3□□□□□ -2.04
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.26□□□□□ -2.05
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.2□□□□□ -2.06
PRAME-201ENST00000398741 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.1□□□□□ -2.07
PRAME-201ENST00000398741 PHGR1C9JFL3 82 aa1.98□□□□□ -2.09
PRAME-201ENST00000398741 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.3□□□□□ -2.2
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