RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398123.6

ADD1-204, Transcript of adducin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADD1, Length 2,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADD1-204ENST00000398123 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.3□□□□□ -1.56
ADD1-204ENST00000398123 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-9P26371 169 aa5.23□□□□□ -1.57
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.22□□□□□ -1.57
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
ADD1-204ENST00000398123 INE1O15225 51 aa5.2□□□□□ -1.58
ADD1-204ENST00000398123 MT1GP13640 62 aa5.19□□□□□ -1.58
ADD1-204ENST00000398123 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.17□□□□□ -1.58
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.14□□□□□ -1.59
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.13□□□□□ -1.59
ADD1-204ENST00000398123 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.12□□□□□ -1.59
ADD1-204ENST00000398123 MT1MQ8N339 61 aa5.11□□□□□ -1.59
ADD1-204ENST00000398123 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.06□□□□□ -1.6
ADD1-204ENST00000398123 SPRR2EP22531 72 aa5.04□□□□□ -1.6
ADD1-204ENST00000398123 SPRR2BP35325 72 aa5.04□□□□□ -1.6
ADD1-204ENST00000398123 SPRR2AP35326 72 aa5.04□□□□□ -1.6
ADD1-204ENST00000398123 MDN1Q9NU22 5596 aa4.99□□□□□ -1.61
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.98□□□□□ -1.61
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.96□□□□□ -1.62
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.92□□□□□ -1.62
ADD1-204ENST00000398123 SPRR2DP22532 72 aa4.85□□□□□ -1.63
ADD1-204ENST00000398123 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.82□□□□□ -1.64
ADD1-204ENST00000398123 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
ADD1-204ENST00000398123 NEBP20929 6669 aa4.79□□□□□ -1.64
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.67□□□□□ -1.66
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.67□□□□□ -1.66
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.67□□□□□ -1.66
ADD1-204ENST00000398123 LCE3BQ5TA77 95 aa4.65□□□□□ -1.66
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ADD1-204ENST00000398123 MT1AP04731 61 aa4.54□□□□□ -1.68
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.47□□□□□ -1.69
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.4□□□□□ -1.7
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.39□□□□□ -1.71
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.38□□□□□ -1.71
ADD1-204ENST00000398123 LCE4AQ5TA78 99 aa4.32□□□□□ -1.72
ADD1-204ENST00000398123 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP12-4P60329 112 aa4.31□□□□□ -1.72
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.31□□□□□ -1.72
ADD1-204ENST00000398123 MT4P47944 62 aa4.2□□□□□ -1.74
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.15□□□□□ -1.75
ADD1-204ENST00000398123 MT3P25713 68 aa4.13□□□□□ -1.75
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.13□□□□□ -1.75
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.12□□□□□ -1.75
ADD1-204ENST00000398123 LCE1DQ5T752 114 aa4.11□□□□□ -1.75
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.09□□□□□ -1.75
ADD1-204ENST00000398123 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.04□□□□□ -1.76
ADD1-204ENST00000398123 LCE3DQ9BYE3 92 aa4□□□□□ -1.77
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.97□□□□□ -1.77
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.93□□□□□ -1.78
ADD1-204ENST00000398123 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.89□□□□□ -1.79
ADD1-204ENST00000398123 PRM1P04553 51 aa3.82□□□□□ -1.8
ADD1-204ENST00000398123 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.75□□□□□ -1.81
ADD1-204ENST00000398123 LCE1EQ5T753 118 aa3.58□□□□□ -1.84
ADD1-204ENST00000398123 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.55□□□□□ -1.84
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.54□□□□□ -1.84
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.43□□□□□ -1.86
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-8O75690 187 aa3.39□□□□□ -1.87
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.38□□□□□ -1.87
ADD1-204ENST00000398123 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.34□□□□□ -1.87
ADD1-204ENST00000398123 LCE1CQ5T751 118 aa3.32□□□□□ -1.88
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.31□□□□□ -1.88
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.3□□□□□ -1.88
ADD1-204ENST00000398123 MUC5ACP98088 5654 aa3.28□□□□□ -1.88
ADD1-204ENST00000398123 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.25□□□□□ -1.89
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.09□□□□□ -1.92
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.93□□□□□ -1.94
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.93□□□□□ -1.94
ADD1-204ENST00000398123 LCE1FQ5T754 118 aa2.91□□□□□ -1.94
ADD1-204ENST00000398123 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.72□□□□□ -1.97
ADD1-204ENST00000398123 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.59□□□□□ -2
ADD1-204ENST00000398123 PHGR1C9JFL3 82 aa2.51□□□□□ -2.01
ADD1-204ENST00000398123 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.43□□□□□ -2.02
ADD1-204ENST00000398123 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.37□□□□□ -2.03
ADD1-204ENST00000398123 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.59□□□□□ -2.16
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms