RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.04□□□□□ -1.92
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ANKRD42-202ENST00000393389 SSPOA2VEC9 5147 aa2.97□□□□□ -1.93
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.93□□□□□ -1.94
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ANKRD42-202ENST00000393389 SPRR2BP35325 72 aa2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42-202ENST00000393389 SPRR2AP35326 72 aa2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42-202ENST00000393389 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.92□□□□□ -1.94
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ANKRD42-202ENST00000393389 MT1EP04732 61 aa2.88□□□□□ -1.95
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ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.7□□□□□ -1.98
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ANKRD42-202ENST00000393389 NEBP20929 6669 aa2.5□□□□□ -2.01
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.49□□□□□ -2.01
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ANKRD42-202ENST00000393389 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.44□□□□□ -2.02
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ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.41□□□□□ -2.02
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.36□□□□□ -2.03
ANKRD42-202ENST00000393389 LCE1DQ5T752 114 aa2.32□□□□□ -2.04
ANKRD42-202ENST00000393389 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.32□□□□□ -2.04
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.28□□□□□ -2.04
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-9P26371 169 aa2.24□□□□□ -2.05
ANKRD42-202ENST00000393389 LCE1EQ5T753 118 aa2.24□□□□□ -2.05
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ANKRD42-202ENST00000393389 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.06□□□□□ -2.08
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.94□□□□□ -2.1
ANKRD42-202ENST00000393389 LCE1CQ5T751 118 aa1.93□□□□□ -2.1
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.89□□□□□ -2.11
ANKRD42-202ENST00000393389 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.88□□□□□ -2.11
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.85□□□□□ -2.11
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.81□□□□□ -2.12
ANKRD42-202ENST00000393389 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.68□□□□□ -2.14
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-8O75690 187 aa1.67□□□□□ -2.14
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.67□□□□□ -2.14
ANKRD42-202ENST00000393389 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.62□□□□□ -2.15
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.53□□□□□ -2.17
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.49□□□□□ -2.17
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.44□□□□□ -2.18
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.43□□□□□ -2.18
ANKRD42-202ENST00000393389 PHGR1C9JFL3 82 aa1.37□□□□□ -2.19
ANKRD42-202ENST00000393389 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.25□□□□□ -2.21
ANKRD42-202ENST00000393389 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.81□□□□□ -2.28
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