RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375571.5

MAPRE1-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE1, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.18□□□□□ -1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.18□□□□□ -1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1EP04732 61 aa6.17□□□□□ -1.42
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1LQ93083 61 aa6.11□□□□□ -1.43
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.07□□□□□ -1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 MDN1Q9NU22 5596 aa6.06□□□□□ -1.44
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.01□□□□□ -1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.96□□□□□ -1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.96□□□□□ -1.45
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.84□□□□□ -1.47
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.8□□□□□ -1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1MQ8N339 61 aa5.8□□□□□ -1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1GP13640 62 aa5.78□□□□□ -1.48
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.76□□□□□ -1.49
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.76□□□□□ -1.49
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.76□□□□□ -1.49
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.72□□□□□ -1.49
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.59□□□□□ -1.51
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-9P26371 169 aa5.58□□□□□ -1.52
MAPRE1-201ENST00000375571 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
MAPRE1-201ENST00000375571 SPRR2EP22531 72 aa5.51□□□□□ -1.53
MAPRE1-201ENST00000375571 SPRR2BP35325 72 aa5.51□□□□□ -1.53
MAPRE1-201ENST00000375571 SPRR2AP35326 72 aa5.51□□□□□ -1.53
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.49□□□□□ -1.53
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.31□□□□□ -1.56
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE3BQ5TA77 95 aa5.3□□□□□ -1.56
MAPRE1-201ENST00000375571 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.28□□□□□ -1.56
MAPRE1-201ENST00000375571 SPRR2DP22532 72 aa5.27□□□□□ -1.57
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.25□□□□□ -1.57
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.2□□□□□ -1.58
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.19□□□□□ -1.58
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.19□□□□□ -1.58
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.15□□□□□ -1.58
MAPRE1-201ENST00000375571 NEBP20929 6669 aa5.15□□□□□ -1.58
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP12-4P60329 112 aa5.14□□□□□ -1.59
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.11□□□□□ -1.59
MAPRE1-201ENST00000375571 MT1AP04731 61 aa5.07□□□□□ -1.6
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE1DQ5T752 114 aa4.96□□□□□ -1.62
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.81□□□□□ -1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.78□□□□□ -1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.78□□□□□ -1.64
MAPRE1-201ENST00000375571 MT4P47944 62 aa4.76□□□□□ -1.65
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.73□□□□□ -1.65
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.71□□□□□ -1.66
MAPRE1-201ENST00000375571 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.69□□□□□ -1.66
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.62□□□□□ -1.67
MAPRE1-201ENST00000375571 MT3P25713 68 aa4.58□□□□□ -1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 PRM1P04553 51 aa4.54□□□□□ -1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.54□□□□□ -1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.54□□□□□ -1.68
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.49□□□□□ -1.69
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.46□□□□□ -1.7
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE4AQ5TA78 99 aa4.45□□□□□ -1.7
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.31□□□□□ -1.72
MAPRE1-201ENST00000375571 MUC5ACP98088 5654 aa3.99□□□□□ -1.77
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.92□□□□□ -1.78
MAPRE1-201ENST00000375571 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.84□□□□□ -1.79
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE1EQ5T753 118 aa3.79□□□□□ -1.8
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.79□□□□□ -1.8
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-8O75690 187 aa3.68□□□□□ -1.82
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.65□□□□□ -1.83
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE1CQ5T751 118 aa3.61□□□□□ -1.83
MAPRE1-201ENST00000375571 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
MAPRE1-201ENST00000375571 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.47□□□□□ -1.85
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.42□□□□□ -1.86
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.37□□□□□ -1.87
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.25□□□□□ -1.89
MAPRE1-201ENST00000375571 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.2□□□□□ -1.9
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.12□□□□□ -1.91
MAPRE1-201ENST00000375571 LCE1FQ5T754 118 aa3.06□□□□□ -1.92
MAPRE1-201ENST00000375571 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.84□□□□□ -1.95
MAPRE1-201ENST00000375571 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
MAPRE1-201ENST00000375571 PHGR1C9JFL3 82 aa2.74□□□□□ -1.97
MAPRE1-201ENST00000375571 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms