RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361490.8

HPS1-204, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 3,678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-204ENST00000361490 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.1□□□□□ -1.75
HPS1-204ENST00000361490 MT1EP04732 61 aa4.08□□□□□ -1.76
HPS1-204ENST00000361490 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.07□□□□□ -1.76
HPS1-204ENST00000361490 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.05□□□□□ -1.76
HPS1-204ENST00000361490 MT1LQ93083 61 aa4.04□□□□□ -1.76
HPS1-204ENST00000361490 MT1GP13640 62 aa3.98□□□□□ -1.77
HPS1-204ENST00000361490 MDN1Q9NU22 5596 aa3.96□□□□□ -1.78
HPS1-204ENST00000361490 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.94□□□□□ -1.78
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.93□□□□□ -1.78
HPS1-204ENST00000361490 SPRR2EP22531 72 aa3.92□□□□□ -1.78
HPS1-204ENST00000361490 SPRR2BP35325 72 aa3.92□□□□□ -1.78
HPS1-204ENST00000361490 SPRR2AP35326 72 aa3.92□□□□□ -1.78
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.89□□□□□ -1.79
HPS1-204ENST00000361490 MT1MQ8N339 61 aa3.87□□□□□ -1.79
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.85□□□□□ -1.79
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
HPS1-204ENST00000361490 INE1O15225 51 aa3.75□□□□□ -1.81
HPS1-204ENST00000361490 SPRR2DP22532 72 aa3.75□□□□□ -1.81
HPS1-204ENST00000361490 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.72□□□□□ -1.81
HPS1-204ENST00000361490 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.71□□□□□ -1.82
HPS1-204ENST00000361490 LCE3BQ5TA77 95 aa3.69□□□□□ -1.82
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.68□□□□□ -1.82
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.61□□□□□ -1.83
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-9P26371 169 aa3.57□□□□□ -1.84
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.57□□□□□ -1.84
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.51□□□□□ -1.85
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.48□□□□□ -1.85
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.48□□□□□ -1.85
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.48□□□□□ -1.85
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.48□□□□□ -1.85
HPS1-204ENST00000361490 MT4P47944 62 aa3.44□□□□□ -1.86
HPS1-204ENST00000361490 MT1AP04731 61 aa3.38□□□□□ -1.87
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP12-4P60329 112 aa3.38□□□□□ -1.87
HPS1-204ENST00000361490 NEBP20929 6669 aa3.35□□□□□ -1.87
HPS1-204ENST00000361490 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.28□□□□□ -1.89
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.26□□□□□ -1.89
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.21□□□□□ -1.9
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.2□□□□□ -1.9
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.2□□□□□ -1.9
HPS1-204ENST00000361490 MT3P25713 68 aa3.18□□□□□ -1.9
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
HPS1-204ENST00000361490 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.17□□□□□ -1.9
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.15□□□□□ -1.9
HPS1-204ENST00000361490 LCE1DQ5T752 114 aa3.08□□□□□ -1.92
HPS1-204ENST00000361490 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.05□□□□□ -1.92
HPS1-204ENST00000361490 LCE4AQ5TA78 99 aa3.03□□□□□ -1.92
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.99□□□□□ -1.93
HPS1-204ENST00000361490 PRM1P04553 51 aa2.94□□□□□ -1.94
HPS1-204ENST00000361490 LCE1EQ5T753 118 aa2.94□□□□□ -1.94
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.94□□□□□ -1.94
HPS1-204ENST00000361490 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.92□□□□□ -1.94
HPS1-204ENST00000361490 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.79□□□□□ -1.96
HPS1-204ENST00000361490 MUC5ACP98088 5654 aa2.77□□□□□ -1.97
HPS1-204ENST00000361490 LCE1FQ5T754 118 aa2.71□□□□□ -1.98
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.69□□□□□ -1.98
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.65□□□□□ -1.99
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.62□□□□□ -1.99
HPS1-204ENST00000361490 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.57□□□□□ -2
HPS1-204ENST00000361490 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.56□□□□□ -2
HPS1-204ENST00000361490 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-8O75690 187 aa2.4□□□□□ -2.03
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.39□□□□□ -2.03
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.38□□□□□ -2.03
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.38□□□□□ -2.03
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.34□□□□□ -2.03
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.34□□□□□ -2.04
HPS1-204ENST00000361490 LCE1CQ5T751 118 aa2.31□□□□□ -2.04
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.23□□□□□ -2.05
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.12□□□□□ -2.07
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.03□□□□□ -2.08
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2□□□□□ -2.09
HPS1-204ENST00000361490 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
HPS1-204ENST00000361490 PHGR1C9JFL3 82 aa1.75□□□□□ -2.13
HPS1-204ENST00000361490 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.65□□□□□ -2.14
HPS1-204ENST00000361490 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.6 ms