RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354308.7

SYT5-201, Transcript of synaptotagmin 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT5, Length 3,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5-201ENST00000354308 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP12-4P60329 112 aa5.17□□□□□ -1.58
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.17□□□□□ -1.58
SYT5-201ENST00000354308 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.17□□□□□ -1.58
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.13□□□□□ -1.59
SYT5-201ENST00000354308 MDN1Q9NU22 5596 aa5.11□□□□□ -1.59
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.11□□□□□ -1.59
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.11□□□□□ -1.59
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.07□□□□□ -1.6
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.07□□□□□ -1.6
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.07□□□□□ -1.6
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SYT5-201ENST00000354308 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.98□□□□□ -1.61
SYT5-201ENST00000354308 MT1LQ93083 61 aa4.96□□□□□ -1.61
SYT5-201ENST00000354308 MT1GP13640 62 aa4.92□□□□□ -1.62
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.84□□□□□ -1.64
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.79□□□□□ -1.64
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SYT5-201ENST00000354308 SPRR2AP35326 72 aa4.76□□□□□ -1.65
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SYT5-201ENST00000354308 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.6□□□□□ -1.67
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SYT5-201ENST00000354308 SPRR2DP22532 72 aa4.53□□□□□ -1.68
SYT5-201ENST00000354308 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.52□□□□□ -1.69
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SYT5-201ENST00000354308 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.48□□□□□ -1.69
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SYT5-201ENST00000354308 MT4P47944 62 aa4.24□□□□□ -1.73
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SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.07□□□□□ -1.76
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.03□□□□□ -1.76
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SYT5-201ENST00000354308 LCE1DQ5T752 114 aa3.88□□□□□ -1.79
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SYT5-201ENST00000354308 MT3P25713 68 aa3.79□□□□□ -1.8
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.67□□□□□ -1.82
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.62□□□□□ -1.83
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SYT5-201ENST00000354308 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.55□□□□□ -1.84
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SYT5-201ENST00000354308 LCE1FQ5T754 118 aa3.41□□□□□ -1.86
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.35□□□□□ -1.87
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SYT5-201ENST00000354308 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SYT5-201ENST00000354308 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.09□□□□□ -1.91
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.99□□□□□ -1.93
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.99□□□□□ -1.93
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-8O75690 187 aa2.98□□□□□ -1.93
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.97□□□□□ -1.93
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.88□□□□□ -1.95
SYT5-201ENST00000354308 LCE1CQ5T751 118 aa2.87□□□□□ -1.95
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.65□□□□□ -1.99
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.65□□□□□ -1.99
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.61□□□□□ -1.99
SYT5-201ENST00000354308 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.49□□□□□ -2.01
SYT5-201ENST00000354308 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
SYT5-201ENST00000354308 PHGR1C9JFL3 82 aa2.14□□□□□ -2.07
SYT5-201ENST00000354308 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms