RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAC1Q96KF2 57 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1BP07438 61 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-201ENST00000319942 TNP1P09430 55 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGGTB-201ENST00000319942 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE1FQ5T754 118 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1XP80297 61 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGGTB-201ENST00000319942 PP632Q6XCG6 107 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE3AQ5TA76 89 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-201ENST00000319942 USH2AO75445 5202 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0A0MQY5 61 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SSPOA2VEC9 5147 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-201ENST00000319942 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP12-3P60328 96 aa3.84□□□□□ -1.8
RABGGTB-201ENST00000319942 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-201ENST00000319942 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-8O75690 187 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGGTB-201ENST00000319942 KMT2DO14686 5537 aa3.68□□□□□ -1.82
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1EP04732 61 aa3.64□□□□□ -1.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LUZP6Q538Z0 58 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.61□□□□□ -1.83
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE1CQ5T751 118 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1LQ93083 61 aa3.58□□□□□ -1.84
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.57□□□□□ -1.84
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1GP13640 62 aa3.52□□□□□ -1.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFAF8A1L188 74 aa3.47□□□□□ -1.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1MQ8N339 61 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR2EP22531 72 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR2BP35325 72 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR2AP35326 72 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MDN1Q9NU22 5596 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRR2DP22532 72 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGGTB-201ENST00000319942 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-201ENST00000319942 NEBP20929 6669 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1AP04731 61 aa3.05□□□□□ -1.92
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.03□□□□□ -1.92
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3□□□□□ -1.93
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP12-4P60329 112 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-201ENST00000319942 INE1O15225 51 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RABGGTB-201ENST00000319942 MT4P47944 62 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.73□□□□□ -1.97
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.72□□□□□ -1.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.69□□□□□ -1.98
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.33□□□□□ -2.04
RABGGTB-201ENST00000319942 PRM1P04553 51 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-201ENST00000319942 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC5ACP98088 5654 aa2.16□□□□□ -2.06
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
RABGGTB-201ENST00000319942 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
RABGGTB-201ENST00000319942 PHGR1C9JFL3 82 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms