RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 MT1LQ93083 61 aa9.5□□□□□ -0.89
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HOXD8-201ENST00000313173 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-9P26371 169 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.15□□□□□ -0.95
HOXD8-201ENST00000313173 INE1O15225 51 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXD8-201ENST00000313173 MT1GP13640 62 aa9.12□□□□□ -0.95
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa9.09□□□□□ -0.95
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HOXD8-201ENST00000313173 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXD8-201ENST00000313173 SPRR2EP22531 72 aa8.89□□□□□ -0.99
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HOXD8-201ENST00000313173 NEBP20929 6669 aa8.85□□□□□ -0.99
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HOXD8-201ENST00000313173 SPRR2DP22532 72 aa8.56□□□□□ -1.04
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXD8-201ENST00000313173 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
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HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.97□□□□□ -1.13
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HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.62□□□□□ -1.19
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HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.49□□□□□ -1.21
HOXD8-201ENST00000313173 MT4P47944 62 aa7.47□□□□□ -1.21
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP12-4P60329 112 aa7.45□□□□□ -1.22
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXD8-201ENST00000313173 LCE1DQ5T752 114 aa7.35□□□□□ -1.23
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.31□□□□□ -1.24
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HOXD8-201ENST00000313173 LCE3DQ9BYE3 92 aa7.24□□□□□ -1.25
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXD8-201ENST00000313173 LCE3EQ5T5B0 92 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.96□□□□□ -1.3
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD8-201ENST00000313173 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.82□□□□□ -1.32
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HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXD8-201ENST00000313173 PRM1P04553 51 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.29□□□□□ -1.4
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HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-8O75690 187 aa6.06□□□□□ -1.44
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.06□□□□□ -1.44
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HOXD8-201ENST00000313173 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-201ENST00000313173 LCE1CQ5T751 118 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXD8-201ENST00000313173 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.46□□□□□ -1.53
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-201ENST00000313173 LCE1FQ5T754 118 aa4.59□□□□□ -1.67
HOXD8-201ENST00000313173 PHGR1C9JFL3 82 aa4.38□□□□□ -1.71
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD8-201ENST00000313173 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.99□□□□□ -1.77
HOXD8-201ENST00000313173 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.88□□□□□ -1.95
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