RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SPRR2DP22532 72 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC42-201ENST00000293845 MT1LQ93083 61 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC42-201ENST00000293845 MT1GP13640 62 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC42-201ENST00000293845 PP632Q6XCG6 107 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.7□□□□□ -1.66
CCDC42-201ENST00000293845 PRO0628Q9UI54 55 aa4.69□□□□□ -1.66
CCDC42-201ENST00000293845 MT1MQ8N339 61 aa4.65□□□□□ -1.67
CCDC42-201ENST00000293845 LCE3BQ5TA77 95 aa4.62□□□□□ -1.67
CCDC42-201ENST00000293845 PMAIP1Q13794 54 aa4.59□□□□□ -1.67
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.58□□□□□ -1.68
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.57□□□□□ -1.68
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.56□□□□□ -1.68
CCDC42-201ENST00000293845 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC42-201ENST00000293845 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.42□□□□□ -1.7
CCDC42-201ENST00000293845 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.37□□□□□ -1.71
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CCDC42-201ENST00000293845 SVIPQ8NHG7 77 aa4.31□□□□□ -1.72
CCDC42-201ENST00000293845 LCE4AQ5TA78 99 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.26□□□□□ -1.73
CCDC42-201ENST00000293845 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.24□□□□□ -1.73
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.18□□□□□ -1.74
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.17□□□□□ -1.74
CCDC42-201ENST00000293845 LCE1DQ5T752 114 aa4.15□□□□□ -1.74
CCDC42-201ENST00000293845 MT4P47944 62 aa4.13□□□□□ -1.75
CCDC42-201ENST00000293845 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CCDC42-201ENST00000293845 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.08□□□□□ -1.76
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.06□□□□□ -1.76
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CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP12-4P60329 112 aa4.02□□□□□ -1.77
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.99□□□□□ -1.77
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CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.79□□□□□ -1.8
CCDC42-201ENST00000293845 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.78□□□□□ -1.8
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.74□□□□□ -1.81
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.7□□□□□ -1.82
CCDC42-201ENST00000293845 MT3P25713 68 aa3.67□□□□□ -1.82
CCDC42-201ENST00000293845 LUZP6Q538Z0 58 aa3.62□□□□□ -1.83
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.54□□□□□ -1.84
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.52□□□□□ -1.85
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.51□□□□□ -1.85
CCDC42-201ENST00000293845 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.48□□□□□ -1.85
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-8O75690 187 aa3.43□□□□□ -1.86
CCDC42-201ENST00000293845 H3BS24 57 aa3.42□□□□□ -1.86
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.38□□□□□ -1.87
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFAF8A1L188 74 aa3.34□□□□□ -1.88
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.33□□□□□ -1.88
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CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC42-201ENST00000293845 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
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CCDC42-201ENST00000293845 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.07□□□□□ -1.92
CCDC42-201ENST00000293845 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
CCDC42-201ENST00000293845 A0A0A0MQY5 61 aa2.92□□□□□ -1.94
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
CCDC42-201ENST00000293845 INE1O15225 51 aa2.79□□□□□ -1.96
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.76□□□□□ -1.97
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.63□□□□□ -1.99
CCDC42-201ENST00000293845 LCE1FQ5T754 118 aa2.61□□□□□ -1.99
CCDC42-201ENST00000293845 PRM1P04553 51 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC42-201ENST00000293845 PHGR1C9JFL3 82 aa2.36□□□□□ -2.03
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.32□□□□□ -2.04
CCDC42-201ENST00000293845 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.13□□□□□ -2.07
CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.61□□□□□ -2.15
CCDC42-201ENST00000293845 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.52□□□□□ -2.17
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