RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.03□□□□□ -1.28
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.98□□□□□ -1.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2Q1-201ENST00000292211 MDN1Q9NU22 5596 aa6.96□□□□□ -1.3
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UBE2Q1-201ENST00000292211 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.91□□□□□ -1.3
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP12-4P60329 112 aa6.81□□□□□ -1.32
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UBE2Q1-201ENST00000292211 SPRR2BP35325 72 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPRR2AP35326 72 aa6.62□□□□□ -1.35
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.58□□□□□ -1.36
UBE2Q1-201ENST00000292211 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.39□□□□□ -1.39
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPRR2DP22532 72 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.33□□□□□ -1.4
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.22□□□□□ -1.41
UBE2Q1-201ENST00000292211 NEBP20929 6669 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRM1P04553 51 aa6.18□□□□□ -1.42
UBE2Q1-201ENST00000292211 MT1AP04731 61 aa6.13□□□□□ -1.43
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.74□□□□□ -1.49
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.68□□□□□ -1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 MT4P47944 62 aa5.67□□□□□ -1.5
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.63□□□□□ -1.51
UBE2Q1-201ENST00000292211 MT3P25713 68 aa5.58□□□□□ -1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCE1DQ5T752 114 aa5.58□□□□□ -1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.55□□□□□ -1.52
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.52□□□□□ -1.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.48□□□□□ -1.53
UBE2Q1-201ENST00000292211 LCE4AQ5TA78 99 aa5.41□□□□□ -1.54
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.3□□□□□ -1.56
UBE2Q1-201ENST00000292211 MUC19Q7Z5P9 8384 aa5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.04□□□□□ -1.6
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.41□□□□□ -1.7
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UBE2Q1-201ENST00000292211 LCE1CQ5T751 118 aa4.3□□□□□ -1.72
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.29□□□□□ -1.72
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.25□□□□□ -1.73
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.05□□□□□ -1.76
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UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.81□□□□□ -1.8
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.8□□□□□ -1.8
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.72□□□□□ -1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.61□□□□□ -1.83
UBE2Q1-201ENST00000292211 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
UBE2Q1-201ENST00000292211 PHGR1C9JFL3 82 aa3.23□□□□□ -1.89
UBE2Q1-201ENST00000292211 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.06□□□□□ -2.08
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