RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.96□□□□□ -1.78
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CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.83□□□□□ -1.8
CNGA3-201ENST00000272602 MDN1Q9NU22 5596 aa3.83□□□□□ -1.8
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.82□□□□□ -1.8
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.75□□□□□ -1.81
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.72□□□□□ -1.81
CNGA3-201ENST00000272602 SPRR2EP22531 72 aa3.7□□□□□ -1.82
CNGA3-201ENST00000272602 SPRR2BP35325 72 aa3.7□□□□□ -1.82
CNGA3-201ENST00000272602 SPRR2AP35326 72 aa3.7□□□□□ -1.82
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.68□□□□□ -1.82
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.68□□□□□ -1.82
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.68□□□□□ -1.82
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP12-4P60329 112 aa3.61□□□□□ -1.83
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CNGA3-201ENST00000272602 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.59□□□□□ -1.83
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CNGA3-201ENST00000272602 SPRR2DP22532 72 aa3.53□□□□□ -1.84
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CNGA3-201ENST00000272602 LCE3BQ5TA77 95 aa3.4□□□□□ -1.86
CNGA3-201ENST00000272602 MT1MQ8N339 61 aa3.39□□□□□ -1.87
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CNGA3-201ENST00000272602 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.38□□□□□ -1.87
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CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.35□□□□□ -1.87
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.29□□□□□ -1.88
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CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CNGA3-201ENST00000272602 MT1AP04731 61 aa3□□□□□ -1.93
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CNGA3-201ENST00000272602 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.79□□□□□ -1.96
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.78□□□□□ -1.96
CNGA3-201ENST00000272602 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.77□□□□□ -1.97
CNGA3-201ENST00000272602 MT3P25713 68 aa2.77□□□□□ -1.97
CNGA3-201ENST00000272602 MUC5ACP98088 5654 aa2.76□□□□□ -1.97
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CNGA3-201ENST00000272602 LCE4AQ5TA78 99 aa2.69□□□□□ -1.98
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.61□□□□□ -1.99
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CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.53□□□□□ -2
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.51□□□□□ -2.01
CNGA3-201ENST00000272602 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.46□□□□□ -2.02
CNGA3-201ENST00000272602 LCE1FQ5T754 118 aa2.29□□□□□ -2.04
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-8O75690 187 aa2.29□□□□□ -2.04
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.29□□□□□ -2.04
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.22□□□□□ -2.05
CNGA3-201ENST00000272602 LCE1CQ5T751 118 aa2.16□□□□□ -2.06
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.15□□□□□ -2.06
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.1□□□□□ -2.07
CNGA3-201ENST00000272602 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.86□□□□□ -2.11
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.85□□□□□ -2.11
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.83□□□□□ -2.12
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.67□□□□□ -2.14
CNGA3-201ENST00000272602 PHGR1C9JFL3 82 aa1.6□□□□□ -2.15
CNGA3-201ENST00000272602 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.08□□□□□ -2.24
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