RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 MDN1Q9NU22 5596 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD11-201ENST00000249504 MT1EP04732 61 aa7.17□□□□□ -1.26
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP12-3P60328 96 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXD11-201ENST00000249504 SPRR2DP22532 72 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXD11-201ENST00000249504 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.96□□□□□ -1.29
HOXD11-201ENST00000249504 MT1LQ93083 61 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD11-201ENST00000249504 MT1GP13640 62 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXD11-201ENST00000249504 LCE3BQ5TA77 95 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXD11-201ENST00000249504 MT1MQ8N339 61 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD11-201ENST00000249504 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HOXD11-201ENST00000249504 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXD11-201ENST00000249504 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD11-201ENST00000249504 LUZP6Q538Z0 58 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD11-201ENST00000249504 LCE4AQ5TA78 99 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD11-201ENST00000249504 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.2□□□□□ -1.42
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFAF8A1L188 74 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HOXD11-201ENST00000249504 MT4P47944 62 aa6.15□□□□□ -1.42
HOXD11-201ENST00000249504 LCE1DQ5T752 114 aa6.15□□□□□ -1.42
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXD11-201ENST00000249504 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.96□□□□□ -1.45
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP12-4P60329 112 aa5.94□□□□□ -1.46
HOXD11-201ENST00000249504 MT1AP04731 61 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXD11-201ENST00000249504 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXD11-201ENST00000249504 H3BS24 57 aa5.74□□□□□ -1.49
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXD11-201ENST00000249504 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXD11-201ENST00000249504 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.49□□□□□ -1.53
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0A0MQY5 61 aa5.48□□□□□ -1.53
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.48□□□□□ -1.53
HOXD11-201ENST00000249504 MT3P25713 68 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD11-201ENST00000249504 INE1O15225 51 aa5.15□□□□□ -1.58
HOXD11-201ENST00000249504 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.07□□□□□ -1.6
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-8O75690 187 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD11-201ENST00000249504 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.86□□□□□ -1.63
HOXD11-201ENST00000249504 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.85□□□□□ -1.63
HOXD11-201ENST00000249504 LCE1EQ5T753 118 aa4.82□□□□□ -1.64
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXD11-201ENST00000249504 MUC5ACP98088 5654 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXD11-201ENST00000249504 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.55□□□□□ -1.68
HOXD11-201ENST00000249504 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXD11-201ENST00000249504 LCE1CQ5T751 118 aa4.47□□□□□ -1.69
HOXD11-201ENST00000249504 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HOXD11-201ENST00000249504 PRM1P04553 51 aa4.18□□□□□ -1.74
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.85□□□□□ -1.79
HOXD11-201ENST00000249504 LCE1FQ5T754 118 aa3.8□□□□□ -1.8
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.46□□□□□ -1.86
HOXD11-201ENST00000249504 PHGR1C9JFL3 82 aa3.44□□□□□ -1.86
HOXD11-201ENST00000249504 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.1□□□□□ -1.91
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.58□□□□□ -2
HOXD11-201ENST00000249504 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.25□□□□□ -2.05
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