RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXD10-201ENST00000249501 LUZP6Q538Z0 58 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXD10-201ENST00000249501 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXD10-201ENST00000249501 MT1EP04732 61 aa6.9□□□□□ -1.3
HOXD10-201ENST00000249501 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.88□□□□□ -1.31
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXD10-201ENST00000249501 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HOXD10-201ENST00000249501 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD10-201ENST00000249501 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD10-201ENST00000249501 MT1LQ93083 61 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD10-201ENST00000249501 A0A0A0MQY5 61 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXD10-201ENST00000249501 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXD10-201ENST00000249501 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-9P26371 169 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXD10-201ENST00000249501 MT1GP13640 62 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXD10-201ENST00000249501 MT1MQ8N339 61 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD10-201ENST00000249501 MDN1Q9NU22 5596 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.46□□□□□ -1.37
HOXD10-201ENST00000249501 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXD10-201ENST00000249501 SPRR2EP22531 72 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD10-201ENST00000249501 SPRR2BP35325 72 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD10-201ENST00000249501 SPRR2AP35326 72 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXD10-201ENST00000249501 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HOXD10-201ENST00000249501 INE1O15225 51 aa6.15□□□□□ -1.42
HOXD10-201ENST00000249501 SPRR2DP22532 72 aa6.15□□□□□ -1.43
HOXD10-201ENST00000249501 NEBP20929 6669 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.74□□□□□ -1.49
HOXD10-201ENST00000249501 MT1AP04731 61 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXD10-201ENST00000249501 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.53□□□□□ -1.52
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP12-4P60329 112 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXD10-201ENST00000249501 MT4P47944 62 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXD10-201ENST00000249501 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXD10-201ENST00000249501 MT3P25713 68 aa5.18□□□□□ -1.58
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.04□□□□□ -1.6
HOXD10-201ENST00000249501 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.04□□□□□ -1.6
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HOXD10-201ENST00000249501 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.89□□□□□ -1.63
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.65□□□□□ -1.67
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
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HOXD10-201ENST00000249501 LCE1EQ5T753 118 aa4.47□□□□□ -1.69
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HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.37□□□□□ -1.71
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-8O75690 187 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.3□□□□□ -1.72
HOXD10-201ENST00000249501 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.27□□□□□ -1.73
HOXD10-201ENST00000249501 MUC5ACP98088 5654 aa4.26□□□□□ -1.73
HOXD10-201ENST00000249501 LCE1CQ5T751 118 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.15□□□□□ -1.74
HOXD10-201ENST00000249501 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.08□□□□□ -1.76
HOXD10-201ENST00000249501 LCE1FQ5T754 118 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.85□□□□□ -1.79
HOXD10-201ENST00000249501 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.74□□□□□ -1.81
HOXD10-201ENST00000249501 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HOXD10-201ENST00000249501 PHGR1C9JFL3 82 aa3.16□□□□□ -1.9
HOXD10-201ENST00000249501 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.95□□□□□ -1.94
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.81□□□□□ -1.96
HOXD10-201ENST00000249501 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.07□□□□□ -2.08
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