RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR2DP22532 72 aa3.95□□□□□ -1.78
PRRX1-201ENST00000239461 KMT2DO14686 5537 aa3.95□□□□□ -1.78
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.91□□□□□ -1.78
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.88□□□□□ -1.79
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.87□□□□□ -1.79
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.87□□□□□ -1.79
PRRX1-201ENST00000239461 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.86□□□□□ -1.79
PRRX1-201ENST00000239461 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.75□□□□□ -1.81
PRRX1-201ENST00000239461 MT1EP04732 61 aa3.71□□□□□ -1.82
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PRRX1-201ENST00000239461 MT1LQ93083 61 aa3.68□□□□□ -1.82
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-9P26371 169 aa3.66□□□□□ -1.82
PRRX1-201ENST00000239461 MT4P47944 62 aa3.65□□□□□ -1.83
PRRX1-201ENST00000239461 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.65□□□□□ -1.83
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP12-4P60329 112 aa3.64□□□□□ -1.83
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.63□□□□□ -1.83
PRRX1-201ENST00000239461 MT1GP13640 62 aa3.63□□□□□ -1.83
PRRX1-201ENST00000239461 MDN1Q9NU22 5596 aa3.59□□□□□ -1.83
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.59□□□□□ -1.83
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.58□□□□□ -1.84
PRRX1-201ENST00000239461 LCE3BQ5TA77 95 aa3.56□□□□□ -1.84
PRRX1-201ENST00000239461 MT1MQ8N339 61 aa3.5□□□□□ -1.85
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.5□□□□□ -1.85
PRRX1-201ENST00000239461 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.5□□□□□ -1.85
PRRX1-201ENST00000239461 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.43□□□□□ -1.86
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.42□□□□□ -1.86
PRRX1-201ENST00000239461 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.42□□□□□ -1.86
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.41□□□□□ -1.86
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.41□□□□□ -1.86
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.41□□□□□ -1.86
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.4□□□□□ -1.86
PRRX1-201ENST00000239461 NEBP20929 6669 aa3.36□□□□□ -1.87
PRRX1-201ENST00000239461 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.35□□□□□ -1.87
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.32□□□□□ -1.88
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.32□□□□□ -1.88
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.22□□□□□ -1.89
PRRX1-201ENST00000239461 LCE1DQ5T752 114 aa3.2□□□□□ -1.9
PRRX1-201ENST00000239461 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.2□□□□□ -1.9
PRRX1-201ENST00000239461 PRM1P04553 51 aa3.18□□□□□ -1.9
PRRX1-201ENST00000239461 MT1AP04731 61 aa3.17□□□□□ -1.9
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.1□□□□□ -1.91
PRRX1-201ENST00000239461 MT3P25713 68 aa3.1□□□□□ -1.91
PRRX1-201ENST00000239461 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.09□□□□□ -1.91
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.08□□□□□ -1.92
PRRX1-201ENST00000239461 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.06□□□□□ -1.92
PRRX1-201ENST00000239461 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.04□□□□□ -1.92
PRRX1-201ENST00000239461 LCE1EQ5T753 118 aa3.04□□□□□ -1.92
PRRX1-201ENST00000239461 LCE4AQ5TA78 99 aa2.99□□□□□ -1.93
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.97□□□□□ -1.93
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.88□□□□□ -1.95
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.83□□□□□ -1.96
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.78□□□□□ -1.96
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.78□□□□□ -1.96
PRRX1-201ENST00000239461 LCE1CQ5T751 118 aa2.76□□□□□ -1.97
PRRX1-201ENST00000239461 LCE1FQ5T754 118 aa2.76□□□□□ -1.97
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.76□□□□□ -1.97
PRRX1-201ENST00000239461 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.74□□□□□ -1.97
PRRX1-201ENST00000239461 MUC5ACP98088 5654 aa2.67□□□□□ -1.98
PRRX1-201ENST00000239461 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.6□□□□□ -1.99
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.58□□□□□ -2
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.5□□□□□ -2.01
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.47□□□□□ -2.01
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.42□□□□□ -2.02
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.4□□□□□ -2.02
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.4□□□□□ -2.02
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-8O75690 187 aa2.37□□□□□ -2.03
PRRX1-201ENST00000239461 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PRRX1-201ENST00000239461 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.29□□□□□ -2.04
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.03□□□□□ -2.08
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.03□□□□□ -2.08
PRRX1-201ENST00000239461 PHGR1C9JFL3 82 aa1.97□□□□□ -2.09
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.71□□□□□ -2.14
PRRX1-201ENST00000239461 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms