RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 MT3P25713 68 aa3.6□□□□□ -1.83
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR2EP22531 72 aa3.58□□□□□ -1.84
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR2BP35325 72 aa3.58□□□□□ -1.84
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR2AP35326 72 aa3.58□□□□□ -1.84
ZBED4-201ENST00000216268 MT1LQ93083 61 aa3.56□□□□□ -1.84
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.54□□□□□ -1.84
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.54□□□□□ -1.84
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.54□□□□□ -1.84
ZBED4-201ENST00000216268 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ZBED4-201ENST00000216268 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.47□□□□□ -1.85
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR2DP22532 72 aa3.45□□□□□ -1.86
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ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.44□□□□□ -1.86
ZBED4-201ENST00000216268 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.42□□□□□ -1.86
ZBED4-201ENST00000216268 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.38□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.38□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.36□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.34□□□□□ -1.87
ZBED4-201ENST00000216268 SSPOA2VEC9 5147 aa3.32□□□□□ -1.88
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.3□□□□□ -1.88
ZBED4-201ENST00000216268 MT1MQ8N339 61 aa3.27□□□□□ -1.89
ZBED4-201ENST00000216268 MT1AP04731 61 aa3.26□□□□□ -1.89
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.2□□□□□ -1.9
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.19□□□□□ -1.9
ZBED4-201ENST00000216268 MT4P47944 62 aa3.19□□□□□ -1.9
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.15□□□□□ -1.91
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.13□□□□□ -1.91
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ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.02□□□□□ -1.93
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ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.94□□□□□ -1.94
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ZBED4-201ENST00000216268 LCE1EQ5T753 118 aa2.74□□□□□ -1.97
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ZBED4-201ENST00000216268 LCE1CQ5T751 118 aa2.7□□□□□ -1.98
ZBED4-201ENST00000216268 LCE1FQ5T754 118 aa2.7□□□□□ -1.98
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.7□□□□□ -1.98
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.68□□□□□ -1.98
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.48□□□□□ -2.01
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.37□□□□□ -2.03
ZBED4-201ENST00000216268 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.31□□□□□ -2.04
ZBED4-201ENST00000216268 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.3□□□□□ -2.04
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ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.26□□□□□ -2.05
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.16□□□□□ -2.06
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.16□□□□□ -2.06
ZBED4-201ENST00000216268 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.15□□□□□ -2.06
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.14□□□□□ -2.07
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.12□□□□□ -2.07
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.02□□□□□ -2.09
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-8O75690 187 aa2□□□□□ -2.09
ZBED4-201ENST00000216268 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.97□□□□□ -2.09
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.87□□□□□ -2.11
ZBED4-201ENST00000216268 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.86□□□□□ -2.11
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.85□□□□□ -2.11
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.75□□□□□ -2.13
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.67□□□□□ -2.14
ZBED4-201ENST00000216268 PHGR1C9JFL3 82 aa1.66□□□□□ -2.14
ZBED4-201ENST00000216268 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.59□□□□□ -2.16
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.51□□□□□ -2.17
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
ZBED4-201ENST00000216268 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.04□□□□□ -2.24
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