RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ighv3-8	A0A075B5T0	131 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trav14n-3	A0A075B645	120 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ighv8-12	A0A0G2JDE1	119 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igkv4-54	A0A0G2JES9	117 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ube2dnl2	A2AFH2	155 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mrps21	P58059	87 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10912	Q3UXH0	145 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem204	Q7TQI0	226 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ifitm10	Q8BR26	201 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spint4	Q9D263	159 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4930564D02Rik	Q9D4S4	103 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9D7E4	109 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009		Q9DAA7	145 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rspo1	Q9Z132	265 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igkv4-50	A0A0B4J1J0	117 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sh2d1b	O35324	132 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppib	P24369	216 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rmi2	Q3UPE3	149 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm9837	Q8C607	126 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Brk1	Q91VR8	75 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sost	Q99P68	211 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf22	Q9ERU3	237 aa		2.81	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm15446	D3Z5Y8	553 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Znf431	E9QAG8	526 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P06323	132 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpl29	P47915	160 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcbd1	P61458	104 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	4930518I15Rik	Q3V2W7	57 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psmf1	Q8BHL8	271 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Srrm4	Q8BKA3	608 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr490	Q8VFD2	314 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tex48	Q9DA81	110 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Notch4	P31695	1964 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kmt2b	O08550	2713 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igkv4-91	A0A075B5L2	119 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm29644	A0A087WPG2	191 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Defa28	D3Z1V9	94 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm20696	H3BJN7	74 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mymx	Q2Q5T5	84 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Defa25	Q5G864	92 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krtap4-13	Q9D7P3	165 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dusp21	Q9D9D8	189 aa		2.8	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trav6n-6	A0A075B6B2	114 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm44790	A0A0N4SV91	103 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm20219	A0A1B0GRQ3	87 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spaar	A0A1B0GSZ0	75 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Polr2j	O08740	117 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ebi3	O35228	228 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	1810049J17Rik	Q3V2G9	153 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pmis2	Q497Q9	96 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem91	Q8C581	172 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dleu7	Q8CHZ8	209 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Efcab10	Q9D581	132 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lyzl4	Q9D925	145 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smpx	Q9DC77	85 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ighv7-3	A0A075B5R2	120 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm10135	F6TEE5	83 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prss2	P07146	246 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp2	P08043	459 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gzmc	P08882	248 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ghrh	P16043	103 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc25a4	P48962	298 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Crct1	Q6PAI5	102 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cbln1	Q9R171	193 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rp1	P56716	2095 aa		2.79	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trdv5	A0A075B661	115 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Col8a2	P25318	699 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cnep1r1	Q3UJ81	125 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm2a	Q60648	193 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mapk1ip1	Q9D7G9	263 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Timm17b	Q9Z0V7	172 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prss1	Q9Z1R9	246 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm21834	J3QN05	151 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P01790	122 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P06321	130 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Defa1	P11477	93 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gabarapl1	Q8R3R8	117 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Otos	Q8R448	89 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem123	Q91Z22	195 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lyzl1	Q9CPX3	148 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psenen	Q9CQR7	101 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr38	Q9D994	303 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lyzl6	Q9DA11	148 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dock7	Q8R1A4	2130 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Szt2	A2A9C3	3431 aa		2.78	□□□□□ -1.96
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ighv1-58	A0A075B5W9	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lce1f	B9EJP6	147 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp708	F8VPP0	541 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009		P18533	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tm2d3	Q8BJ83	261 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ssr2	Q9CPW5	183 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ep400	Q8CHI8	3072 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm42543	A0A0G2JET4	117 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Leprot	O89013	131 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lta	P09225	202 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pkia	P63248	76 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ube2l3	P68037	154 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sbspon	Q3UPR9	264 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm9958	Q8C9U4	106 aa		2.77	□□□□□ -1.97
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Alpk2	Q91ZB0	2144 aa		2.77	□□□□□ -1.97

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