RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smim13E9Q942 88 aa9.75□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfge8P21956 463 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1243Q8VGM7 305 aa9.75□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D131 166 aa9.75□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl53Q9D1H8 118 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Josd1Q9DBJ6 202 aa9.75□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PerpQ9JK95 193 aa9.75□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17334Q8C6U3 126 aa9.75□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl20Q9CQL4 149 aa9.75□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tspo2Q9CRZ8 162 aa9.75□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav14n-2A0A0G2JDF5 121 aa9.74□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esp38A8R0X1 80 aa9.74□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tstd1E9PY03 133 aa9.74□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC030500E9Q6W0 185 aa9.74□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7489Q3UT34 171 aa9.74□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk15Q8CGR4 254 aa9.74□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2l6Q9QZU9 153 aa9.74□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab9aQ9R0M6 201 aa9.74□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Minos1Q7TNS2 76 aa9.73□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxc12Q8K5B8 280 aa9.73□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav16nA0A075B634 117 aa9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h1tQ07133 208 aa9.72□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Omt2bD3YX29 119 aa9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6lH3BJG9 140 aa9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TbpP29037 316 aa9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10604Q3V0X7 143 aa9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35d2Q762D5 326 aa9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r197Q8R265 298 aa9.72□□□□□ -0.85
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gnb1lQ9EQ15 326 aa9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sertad4A7DTG3 377 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21994F6T2D2 329 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17455G3UW87 128 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adrb3P25962 400 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PdpnQ62011 172 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snx22Q8C084 192 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 QrfpQ8CE23 124 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CX25 107 aa9.71□□□□□ -0.85
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav7-5A0A0G2JFX6 112 aa9.71□□□□□ -0.86
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfdc2Q9DAU7 174 aa9.71□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r63Q9EPT1 300 aa9.71□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekhb2Q9QZC7 221 aa9.71□□□□□ -0.86
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr981Q8VEU2 310 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm12057A0A087WR21 115 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esp23A8R0V5 104 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gata3P23772 443 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf239P24399 201 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UNZ8 350 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl15Q91W61 300 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rabac1Q9Z0S9 185 aa9.7□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtatp8P03930 67 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sub1P11031 127 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bsph2Q0Q236 131 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znhit3Q9CQK1 151 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl33Q9CQP0 65 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CtrlQ9ER05 264 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec11aQ9R0P6 179 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem141A2AJB2 108 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6040Q4QY32 63 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr9Q8BV84 116 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr365Q8VFT2 312 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cby1Q9D1C2 127 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fxyd7P59648 80 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ripply2Q2WG76 128 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D630044L22RikQ8C701 164 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1431Q8VF59 312 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr873Q8VFJ0 319 aa9.69□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb1bp1O35671 200 aa9.68□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01820 115 aa9.68□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5105Q8C6Y9 112 aa9.68□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ins2P01326 110 aa9.68□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ang2Q64438 145 aa9.68□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem11Q8BK08 190 aa9.68□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem97Q8VD00 176 aa9.68□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa9.67□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01756 117 aa9.67□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01757 117 aa9.67□□□□□ -0.86
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