RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC00643Q86TS7 51 aa8.6□□□□□ -1.03
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A087WVE0 104 aa8.59□□□□□ -1.03
ANKRD54-211ENST00000609454 NDUFC1O43677 76 aa8.59□□□□□ -1.03
ANKRD54-211ENST00000609454 IMUPQ9GZP8 106 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD54-211ENST00000609454 MT1BP07438 61 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC00208Q96KT6 92 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD54-211ENST00000609454 CRIPTQ9P021 101 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD54-211ENST00000609454 MP68P56378 58 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD54-211ENST00000609454 A8MUN3 132 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A1B0GV90 55 aa8.44□□□□□ -1.06
ANKRD54-211ENST00000609454 H0YAA0 97 aa8.43□□□□□ -1.06
ANKRD54-211ENST00000609454 J3QR89 54 aa8.42□□□□□ -1.06
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP10-5P60370 271 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD54-211ENST00000609454 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD54-211ENST00000609454 OCR1Q9BZK8 76 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD54-211ENST00000609454 SCGB1A1P11684 91 aa8.38□□□□□ -1.07
ANKRD54-211ENST00000609454 H3BPC8 53 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD54-211ENST00000609454 C20orf197Q8N268 126 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD54-211ENST00000609454 R4GN34 69 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD54-211ENST00000609454 PLAC4Q8WY50 150 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD54-211ENST00000609454 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.21□□□□□ -1.1
ANKRD54-211ENST00000609454 DMAC1Q96GE9 116 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD54-211ENST00000609454 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.15□□□□□ -1.1
ANKRD54-211ENST00000609454 M0QZ58 72 aa8.15□□□□□ -1.1
ANKRD54-211ENST00000609454 NEBP20929 6669 aa8.14□□□□□ -1.11
ANKRD54-211ENST00000609454 P0C880 135 aa8.14□□□□□ -1.11
ANKRD54-211ENST00000609454 ACYP2P14621 99 aa8.09□□□□□ -1.11
ANKRD54-211ENST00000609454 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC01554Q52M75 96 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-9P26371 169 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.07□□□□□ -1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 K7ERU9 68 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 MT-ATP8P03928 68 aa8.03□□□□□ -1.12
ANKRD54-211ENST00000609454 MT1XP80297 61 aa8.02□□□□□ -1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.01□□□□□ -1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8□□□□□ -1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 KMT2DO14686 5537 aa7.98□□□□□ -1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.98□□□□□ -1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 MDN1Q9NU22 5596 aa7.97□□□□□ -1.13
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SNURFQ9Y675 71 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP12-2P59991 146 aa7.85□□□□□ -1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRR2EP22531 72 aa7.84□□□□□ -1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRR2BP35325 72 aa7.84□□□□□ -1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRR2AP35326 72 aa7.84□□□□□ -1.15
ANKRD54-211ENST00000609454 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.75□□□□□ -1.17
ANKRD54-211ENST00000609454 SERP2Q8N6R1 65 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.7□□□□□ -1.18
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.64□□□□□ -1.19
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP10-12P60413 245 aa7.62□□□□□ -1.19
ANKRD54-211ENST00000609454 SEC61GP60059 68 aa7.61□□□□□ -1.19
ANKRD54-211ENST00000609454 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.61□□□□□ -1.19
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRR2DP22532 72 aa7.58□□□□□ -1.2
ANKRD54-211ENST00000609454 COA5Q86WW8 74 aa7.58□□□□□ -1.2
ANKRD54-211ENST00000609454 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.57□□□□□ -1.2
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.54□□□□□ -1.2
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.51□□□□□ -1.21
ANKRD54-211ENST00000609454 COX7CP15954 63 aa7.47□□□□□ -1.21
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A0D9SG42 100 aa7.46□□□□□ -1.22
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A1B0GU33 70 aa7.38□□□□□ -1.23
ANKRD54-211ENST00000609454 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.38□□□□□ -1.23
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.37□□□□□ -1.23
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE3BQ5TA77 95 aa7.36□□□□□ -1.23
ANKRD54-211ENST00000609454 H7BZZ5 65 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD54-211ENST00000609454 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A1B0GU69 56 aa7.25□□□□□ -1.25
ANKRD54-211ENST00000609454 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD54-211ENST00000609454 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP12-1P59990 96 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD54-211ENST00000609454 MT1EP04732 61 aa7.12□□□□□ -1.27
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.09□□□□□ -1.27
ANKRD54-211ENST00000609454 A8MU10 97 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 PRR15LQ9BU68 103 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.03□□□□□ -1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC179H3BU77 68 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 PP632Q6XCG6 107 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD54-211ENST00000609454 TNP1P09430 55 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 MT1GP13640 62 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD54-211ENST00000609454 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE3AQ5TA76 89 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD54-211ENST00000609454 MT1LQ93083 61 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 MT1MQ8N339 61 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 UQCR11O14957 56 aa6.78□□□□□ -1.32
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM258P61165 79 aa6.77□□□□□ -1.33
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE4AQ5TA78 99 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms