RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 J3QR89 54 aa2.6□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SIGMAR1Q99720 223 aa2.6□□□□□ -1.99
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MT2AP02795 61 aa2.58□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKV4-1P06312 121 aa2.58□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NREPQ16612 68 aa2.58□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ETDBQ3ZM63 59 aa2.58□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 Q6ZQT0 140 aa2.58□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.57□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C8orf87E5RJ46 101 aa2.57□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MT1FP04733 61 aa2.57□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.57□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C14orf132Q9NPU4 83 aa2.57□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NEBP20929 6669 aa2.56□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.56□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.56□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00313P59037 77 aa2.56□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBL5Q9BZL1 73 aa2.56□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.54□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.54□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.53□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A8MWP4 228 aa2.53□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ACYP1P07311 99 aa2.53□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCGB1A1P11684 91 aa2.53□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.53□□□□□ -2
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 M0R2T5 61 aa2.52□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.51□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 K7EQZ3 153 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa2.5□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NDUFS5O43920 106 aa2.49□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPINK7P58062 85 aa2.49□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRR15Q8IV56 129 aa2.49□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 hDV103S1A0JD37 113 aa2.48□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MT-ATP8P03928 68 aa2.48□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.48□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.48□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CASC2Q6XLA1 102 aa2.47□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00643Q86TS7 51 aa2.47□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00846Q9NV44 126 aa2.47□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.47□□□□□ -2.01
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IMUPQ9GZP8 106 aa2.46□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.46□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.45□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HCG22E2RYF7 251 aa2.45□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM236CP0DP71 79 aa2.45□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.45□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 WFDC13Q8IUB5 93 aa2.44□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.43□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.43□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A0A087WVE0 104 aa2.42□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.42□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LUZP6Q538Z0 58 aa2.42□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.42□□□□□ -2.02
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa2.4□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa2.4□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATOX1O00244 68 aa2.4□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.4□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.39□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 P0C880 135 aa2.39□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C4orf26Q17RF5 130 aa2.39□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.39□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.38□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UQCRQO14949 82 aa2.38□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MT1BP07438 61 aa2.38□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MP68P56378 58 aa2.38□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.38□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMIM20Q8N5G0 67 aa2.37□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H3BPC8 53 aa2.35□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCDC179H3BU77 68 aa2.35□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COX7CP15954 63 aa2.35□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SERP2Q8N6R1 65 aa2.35□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.35□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H0Y9P7 68 aa2.34□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LCA10Q71F78 164 aa2.34□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.34□□□□□ -2.03
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KMT2DO14686 5537 aa2.32□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.32□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PSPHP1O15172 72 aa2.32□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.32□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.32□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 A8MUN3 132 aa2.31□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.31□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KRTAP12-3P60328 96 aa2.3□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KLKP1Q107X0 134 aa2.3□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00208Q96KT6 92 aa2.3□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.3□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM258P61165 79 aa2.29□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 S4R3F8 94 aa2.29□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NDUFC1O43677 76 aa2.28□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CSAG1Q6PB30 78 aa2.28□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C20orf197Q8N268 126 aa2.28□□□□□ -2.04
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.27□□□□□ -2.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MDN1Q9NU22 5596 aa2.27□□□□□ -2.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 H7BZZ5 65 aa2.26□□□□□ -2.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms