RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 IMUPQ9GZP8 106 aa6.81□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.8□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 KLKP1Q107X0 134 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 CRIPTQ9P021 101 aa6.79□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 A6NN06 94 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.78□□□□□ -1.32
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CMTM3-212ENST00000566121 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP10-5P60370 271 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM3-212ENST00000566121 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM3-212ENST00000566121 NEBP20929 6669 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM3-212ENST00000566121 A0A087WVE0 104 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM3-212ENST00000566121 H0YAA0 97 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM3-212ENST00000566121 SCGB1A1P11684 91 aa6.67□□□□□ -1.34
CMTM3-212ENST00000566121 ATOX1O00244 68 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM3-212ENST00000566121 UQCRQO14949 82 aa6.66□□□□□ -1.34
CMTM3-212ENST00000566121 KMT2DO14686 5537 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP5-9P26371 169 aa6.63□□□□□ -1.35
CMTM3-212ENST00000566121 MDN1Q9NU22 5596 aa6.62□□□□□ -1.35
CMTM3-212ENST00000566121 A8MUN3 132 aa6.62□□□□□ -1.35
CMTM3-212ENST00000566121 NDUFC1O43677 76 aa6.6□□□□□ -1.35
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.57□□□□□ -1.36
CMTM3-212ENST00000566121 H0Y9P7 68 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM3-212ENST00000566121 OCR1Q9BZK8 76 aa6.53□□□□□ -1.36
CMTM3-212ENST00000566121 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM3-212ENST00000566121 SERP2Q8N6R1 65 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM3-212ENST00000566121 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM3-212ENST00000566121 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.47□□□□□ -1.37
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.47□□□□□ -1.37
CMTM3-212ENST00000566121 COX7CP15954 63 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00208Q96KT6 92 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.45□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 MP68P56378 58 aa6.44□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.43□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 H3BPC8 53 aa6.42□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 PCP4P48539 62 aa6.4□□□□□ -1.38
CMTM3-212ENST00000566121 C20orf197Q8N268 126 aa6.39□□□□□ -1.39
CMTM3-212ENST00000566121 MT1XP80297 61 aa6.38□□□□□ -1.39
CMTM3-212ENST00000566121 PLAC4Q8WY50 150 aa6.36□□□□□ -1.39
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP12-2P59991 146 aa6.35□□□□□ -1.39
CMTM3-212ENST00000566121 CCDC179H3BU77 68 aa6.34□□□□□ -1.39
CMTM3-212ENST00000566121 DMAC1Q96GE9 116 aa6.33□□□□□ -1.4
CMTM3-212ENST00000566121 R4GN34 69 aa6.33□□□□□ -1.4
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.31□□□□□ -1.4
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.31□□□□□ -1.4
CMTM3-212ENST00000566121 SNURFQ9Y675 71 aa6.31□□□□□ -1.4
CMTM3-212ENST00000566121 P0C880 135 aa6.29□□□□□ -1.4
CMTM3-212ENST00000566121 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.26□□□□□ -1.41
CMTM3-212ENST00000566121 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.24□□□□□ -1.41
CMTM3-212ENST00000566121 M0QZ58 72 aa6.23□□□□□ -1.41
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.23□□□□□ -1.41
CMTM3-212ENST00000566121 H7BZZ5 65 aa6.22□□□□□ -1.41
CMTM3-212ENST00000566121 SPRR2EP22531 72 aa6.19□□□□□ -1.42
CMTM3-212ENST00000566121 SPRR2BP35325 72 aa6.19□□□□□ -1.42
CMTM3-212ENST00000566121 SPRR2AP35326 72 aa6.19□□□□□ -1.42
CMTM3-212ENST00000566121 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.18□□□□□ -1.42
CMTM3-212ENST00000566121 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.17□□□□□ -1.42
CMTM3-212ENST00000566121 ACYP2P14621 99 aa6.16□□□□□ -1.42
CMTM3-212ENST00000566121 TMEM258P61165 79 aa6.16□□□□□ -1.42
CMTM3-212ENST00000566121 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP10-12P60413 245 aa6.12□□□□□ -1.43
CMTM3-212ENST00000566121 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.12□□□□□ -1.43
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.1□□□□□ -1.43
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.1□□□□□ -1.43
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.08□□□□□ -1.44
CMTM3-212ENST00000566121 LINC01554Q52M75 96 aa6.08□□□□□ -1.44
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.08□□□□□ -1.44
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CMTM3-212ENST00000566121 SPRR2DP22532 72 aa6□□□□□ -1.45
CMTM3-212ENST00000566121 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.97□□□□□ -1.45
CMTM3-212ENST00000566121 COA5Q86WW8 74 aa5.95□□□□□ -1.46
CMTM3-212ENST00000566121 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.94□□□□□ -1.46
CMTM3-212ENST00000566121 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CMTM3-212ENST00000566121 LCE3BQ5TA77 95 aa5.87□□□□□ -1.47
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.82□□□□□ -1.48
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.8□□□□□ -1.48
CMTM3-212ENST00000566121 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.76□□□□□ -1.49
CMTM3-212ENST00000566121 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.73□□□□□ -1.49
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.72□□□□□ -1.49
CMTM3-212ENST00000566121 V9GYY9 64 aa5.72□□□□□ -1.49
CMTM3-212ENST00000566121 Q1T7F1 81 aa5.71□□□□□ -1.5
CMTM3-212ENST00000566121 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.71□□□□□ -1.5
CMTM3-212ENST00000566121 SEC61GP60059 68 aa5.68□□□□□ -1.5
CMTM3-212ENST00000566121 MT1EP04732 61 aa5.67□□□□□ -1.5
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.67□□□□□ -1.5
CMTM3-212ENST00000566121 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GU69 56 aa5.65□□□□□ -1.5
CMTM3-212ENST00000566121 PRR15LQ9BU68 103 aa5.64□□□□□ -1.51
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GU33 70 aa5.6□□□□□ -1.51
CMTM3-212ENST00000566121 PSPHP1O15172 72 aa5.57□□□□□ -1.52
CMTM3-212ENST00000566121 A0A0D9SG42 100 aa5.56□□□□□ -1.52
CMTM3-212ENST00000566121 MT1GP13640 62 aa5.56□□□□□ -1.52
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP12-1P59990 96 aa5.55□□□□□ -1.52
CMTM3-212ENST00000566121 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.54□□□□□ -1.52
CMTM3-212ENST00000566121 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.54□□□□□ -1.52
CMTM3-212ENST00000566121 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.51□□□□□ -1.53
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.5□□□□□ -1.53
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.49□□□□□ -1.53
CMTM3-212ENST00000566121 PP632Q6XCG6 107 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms