RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564940.2

CHTF18-215, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 197 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-215ENST00000564940 K7ERU9 68 aa7.19□□□□□ -1.26
CHTF18-215ENST00000564940 KMT2DO14686 5537 aa7.17□□□□□ -1.26
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP5-9P26371 169 aa7.17□□□□□ -1.26
CHTF18-215ENST00000564940 ETDBQ3ZM63 59 aa7.15□□□□□ -1.26
CHTF18-215ENST00000564940 CRIPTQ9P021 101 aa7.15□□□□□ -1.26
CHTF18-215ENST00000564940 MDN1Q9NU22 5596 aa7.14□□□□□ -1.27
CHTF18-215ENST00000564940 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.13□□□□□ -1.27
CHTF18-215ENST00000564940 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.11□□□□□ -1.27
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.08□□□□□ -1.28
CHTF18-215ENST00000564940 IMUPQ9GZP8 106 aa7.07□□□□□ -1.28
CHTF18-215ENST00000564940 H0YAA0 97 aa7.05□□□□□ -1.28
CHTF18-215ENST00000564940 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.03□□□□□ -1.28
CHTF18-215ENST00000564940 ACYP1P07311 99 aa7.03□□□□□ -1.28
CHTF18-215ENST00000564940 NDUFC1O43677 76 aa7.01□□□□□ -1.29
CHTF18-215ENST00000564940 H0Y9P7 68 aa6.99□□□□□ -1.29
CHTF18-215ENST00000564940 UQCRQO14949 82 aa6.99□□□□□ -1.29
CHTF18-215ENST00000564940 ATOX1O00244 68 aa6.97□□□□□ -1.29
CHTF18-215ENST00000564940 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CHTF18-215ENST00000564940 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.96□□□□□ -1.3
CHTF18-215ENST00000564940 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.96□□□□□ -1.3
CHTF18-215ENST00000564940 MT1XP80297 61 aa6.93□□□□□ -1.3
CHTF18-215ENST00000564940 A8MUN3 132 aa6.92□□□□□ -1.3
CHTF18-215ENST00000564940 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.88□□□□□ -1.31
CHTF18-215ENST00000564940 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.88□□□□□ -1.31
CHTF18-215ENST00000564940 LINC00208Q96KT6 92 aa6.87□□□□□ -1.31
CHTF18-215ENST00000564940 LINC00643Q86TS7 51 aa6.86□□□□□ -1.31
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.85□□□□□ -1.31
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.85□□□□□ -1.31
CHTF18-215ENST00000564940 SCGB1A1P11684 91 aa6.83□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 SPRR2EP22531 72 aa6.82□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 SPRR2BP35325 72 aa6.82□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 SPRR2AP35326 72 aa6.82□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 PLAC4Q8WY50 150 aa6.82□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 OCR1Q9BZK8 76 aa6.81□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 P0C880 135 aa6.8□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.79□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 R4GN34 69 aa6.78□□□□□ -1.32
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP12-2P59991 146 aa6.77□□□□□ -1.33
CHTF18-215ENST00000564940 MP68P56378 58 aa6.76□□□□□ -1.33
CHTF18-215ENST00000564940 MT-ATP8P03928 68 aa6.74□□□□□ -1.33
CHTF18-215ENST00000564940 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.74□□□□□ -1.33
CHTF18-215ENST00000564940 M0QZ58 72 aa6.73□□□□□ -1.33
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.73□□□□□ -1.33
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.71□□□□□ -1.34
CHTF18-215ENST00000564940 C20orf197Q8N268 126 aa6.71□□□□□ -1.34
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.71□□□□□ -1.34
CHTF18-215ENST00000564940 DMAC1Q96GE9 116 aa6.69□□□□□ -1.34
CHTF18-215ENST00000564940 H3BPC8 53 aa6.64□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 LINC01554Q52M75 96 aa6.64□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.62□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.62□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 PCP4P48539 62 aa6.6□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 SPRR2DP22532 72 aa6.59□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.59□□□□□ -1.35
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP10-12P60413 245 aa6.57□□□□□ -1.36
CHTF18-215ENST00000564940 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.56□□□□□ -1.36
CHTF18-215ENST00000564940 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.52□□□□□ -1.37
CHTF18-215ENST00000564940 SERP2Q8N6R1 65 aa6.47□□□□□ -1.37
CHTF18-215ENST00000564940 ACYP2P14621 99 aa6.45□□□□□ -1.38
CHTF18-215ENST00000564940 COX7CP15954 63 aa6.45□□□□□ -1.38
CHTF18-215ENST00000564940 LCE3BQ5TA77 95 aa6.44□□□□□ -1.38
CHTF18-215ENST00000564940 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.38□□□□□ -1.39
CHTF18-215ENST00000564940 CCDC179H3BU77 68 aa6.32□□□□□ -1.4
CHTF18-215ENST00000564940 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.31□□□□□ -1.4
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.29□□□□□ -1.4
CHTF18-215ENST00000564940 TMEM258P61165 79 aa6.25□□□□□ -1.41
CHTF18-215ENST00000564940 SNURFQ9Y675 71 aa6.24□□□□□ -1.41
CHTF18-215ENST00000564940 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CHTF18-215ENST00000564940 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.21□□□□□ -1.42
CHTF18-215ENST00000564940 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.19□□□□□ -1.42
CHTF18-215ENST00000564940 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.18□□□□□ -1.42
CHTF18-215ENST00000564940 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.18□□□□□ -1.42
CHTF18-215ENST00000564940 H7BZZ5 65 aa6.17□□□□□ -1.42
CHTF18-215ENST00000564940 MT1EP04732 61 aa6.15□□□□□ -1.42
CHTF18-215ENST00000564940 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.13□□□□□ -1.43
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.12□□□□□ -1.43
CHTF18-215ENST00000564940 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.1□□□□□ -1.43
CHTF18-215ENST00000564940 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.07□□□□□ -1.44
CHTF18-215ENST00000564940 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.04□□□□□ -1.44
CHTF18-215ENST00000564940 A0A0D9SG42 100 aa6.03□□□□□ -1.44
CHTF18-215ENST00000564940 COA5Q86WW8 74 aa6.02□□□□□ -1.45
CHTF18-215ENST00000564940 SPATA8Q6RVD6 105 aa6□□□□□ -1.45
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.98□□□□□ -1.45
CHTF18-215ENST00000564940 MT1GP13640 62 aa5.94□□□□□ -1.46
CHTF18-215ENST00000564940 SEC61GP60059 68 aa5.94□□□□□ -1.46
CHTF18-215ENST00000564940 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.94□□□□□ -1.46
CHTF18-215ENST00000564940 KRTAP12-1P59990 96 aa5.93□□□□□ -1.46
CHTF18-215ENST00000564940 A0A1B0GU33 70 aa5.91□□□□□ -1.46
CHTF18-215ENST00000564940 LCE1DQ5T752 114 aa5.9□□□□□ -1.46
CHTF18-215ENST00000564940 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.89□□□□□ -1.47
CHTF18-215ENST00000564940 PP632Q6XCG6 107 aa5.86□□□□□ -1.47
CHTF18-215ENST00000564940 MT1MQ8N339 61 aa5.86□□□□□ -1.47
CHTF18-215ENST00000564940 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.85□□□□□ -1.47
CHTF18-215ENST00000564940 V9GYY9 64 aa5.85□□□□□ -1.47
CHTF18-215ENST00000564940 MT1LQ93083 61 aa5.84□□□□□ -1.47
CHTF18-215ENST00000564940 LCE4AQ5TA78 99 aa5.81□□□□□ -1.48
CHTF18-215ENST00000564940 MT4P47944 62 aa5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.7 ms