RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551887.2

ITGB7-211, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 4

Gene ITGB7, Length 760 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-211ENST00000551887 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.96□□□□□ -1.78
ITGB7-211ENST00000551887 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.96□□□□□ -1.78
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ITGB7-211ENST00000551887 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ITGB7-211ENST00000551887 LRP2P98164 4655 aa3.95□□□□□ -1.78
ITGB7-211ENST00000551887 LELP1Q5T871 98 aa3.94□□□□□ -1.78
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ITGB7-211ENST00000551887 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.93□□□□□ -1.78
ITGB7-211ENST00000551887 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.92□□□□□ -1.78
ITGB7-211ENST00000551887 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
ITGB7-211ENST00000551887 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.91□□□□□ -1.78
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ITGB7-211ENST00000551887 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.86□□□□□ -1.79
ITGB7-211ENST00000551887 Q6ZRX8 168 aa3.86□□□□□ -1.79
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ITGB7-211ENST00000551887 C14orf177Q52M58 125 aa3.85□□□□□ -1.79
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ITGB7-211ENST00000551887 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3□□□□□ -1.93
ITGB7-211ENST00000551887 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3□□□□□ -1.93
ITGB7-211ENST00000551887 TNP1P09430 55 aa2.9□□□□□ -1.95
ITGB7-211ENST00000551887 MDN1Q9NU22 5596 aa2.9□□□□□ -1.95
ITGB7-211ENST00000551887 KRTAP5-9P26371 169 aa2.86□□□□□ -1.95
ITGB7-211ENST00000551887 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.85□□□□□ -1.95
ITGB7-211ENST00000551887 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.81□□□□□ -1.96
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