RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550722.5

HECTD4-211, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HECTD4, Length 15,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-211ENST00000550722 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.02□□□□□ -1.93
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HECTD4-211ENST00000550722 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
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HECTD4-211ENST00000550722 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.97□□□□□ -1.93
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HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.4□□□□□ -2.02
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HECTD4-211ENST00000550722 HERC1Q15751 4861 aa2.26□□□□□ -2.05
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HECTD4-211ENST00000550722 LRP2P98164 4655 aa2.25□□□□□ -2.05
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HECTD4-211ENST00000550722 MUC17Q685J3 4493 aa2.24□□□□□ -2.05
HECTD4-211ENST00000550722 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.24□□□□□ -2.05
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HECTD4-211ENST00000550722 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.2□□□□□ -2.06
HECTD4-211ENST00000550722 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.19□□□□□ -2.06
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HECTD4-211ENST00000550722 RNF213Q63HN8 5207 aa2.16□□□□□ -2.06
HECTD4-211ENST00000550722 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.15□□□□□ -2.06
HECTD4-211ENST00000550722 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.15□□□□□ -2.07
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.14□□□□□ -2.07
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HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.1□□□□□ -2.07
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HECTD4-211ENST00000550722 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.07□□□□□ -2.08
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.06□□□□□ -2.08
HECTD4-211ENST00000550722 MT1GP13640 62 aa2.05□□□□□ -2.08
HECTD4-211ENST00000550722 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.05□□□□□ -2.08
HECTD4-211ENST00000550722 SPRR2DP22532 72 aa2.03□□□□□ -2.08
HECTD4-211ENST00000550722 LCE2BO14633 110 aa2.01□□□□□ -2.09
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.01□□□□□ -2.09
HECTD4-211ENST00000550722 MT1BP07438 61 aa2□□□□□ -2.09
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2□□□□□ -2.09
HECTD4-211ENST00000550722 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa1.99□□□□□ -2.09
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