RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A1B0GW54	56 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q6ZQT0	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT-ATP8	P03928	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q6ZVQ6	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691	PCP4	P48539	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TXNRD1-223	ENST00000531691	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	CXCL6	P80162	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPRR2D	P22532	72 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDUFS5	O43920	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691		S4R3F8	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATOX1	O00244	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	NREP	Q16612	68 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TXNRD1-223	ENST00000531691	BPY2	O14599	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q5W150	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691	LCA10	Q71F78	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691	UQCRQ	O14949	82 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691		A0A087WVE0	104 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691	COX7C	P15954	63 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TXNRD1-223	ENST00000531691		K7EQZ3	153 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TXNRD1-223	ENST00000531691	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TXNRD1-223	ENST00000531691	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT1X	P80297	61 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q8N9L7	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDUFC1	O43677	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691		A8MUN3	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM258	P61165	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TXNRD1-223	ENST00000531691	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TXNRD1-223	ENST00000531691		H3BPC8	53 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TXNRD1-223	ENST00000531691	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TXNRD1-223	ENST00000531691	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TXNRD1-223	ENST00000531691		H0YAA0	97 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TXNRD1-223	ENST00000531691		H7BZZ5	65 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TXNRD1-223	ENST00000531691	MP68	P56378	58 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691		H0Y9P7	68 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TXNRD1-223	ENST00000531691	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691		R4GN34	69 aa		4.43	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TXNRD1-223	ENST00000531691		M0QZ58	72 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TXNRD1-223	ENST00000531691	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TXNRD1-223	ENST00000531691	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TXNRD1-223	ENST00000531691	MT4	P47944	62 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.28	□□□□□ -1.72
TXNRD1-223	ENST00000531691		P0C880	135 aa		4.27	□□□□□ -1.73
TXNRD1-223	ENST00000531691	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TXNRD1-223	ENST00000531691	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TXNRD1-223	ENST00000531691		V9GYY9	64 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TXNRD1-223	ENST00000531691	ACYP2	P14621	99 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q1T7F1	81 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TXNRD1-223	ENST00000531691	COA5	Q86WW8	74 aa		4.23	□□□□□ -1.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 225.8 ms