RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525334.5

TSPAN4-215, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3

Gene TSPAN4, Length 860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-215ENST00000525334 LINC00208Q96KT6 92 aa8.39□□□□□ -1.07
TSPAN4-215ENST00000525334 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TSPAN4-215ENST00000525334 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TSPAN4-215ENST00000525334 MP68P56378 58 aa8.35□□□□□ -1.07
TSPAN4-215ENST00000525334 KLKP1Q107X0 134 aa8.35□□□□□ -1.07
TSPAN4-215ENST00000525334 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.33□□□□□ -1.08
TSPAN4-215ENST00000525334 A8MUN3 132 aa8.31□□□□□ -1.08
TSPAN4-215ENST00000525334 NDUFC1O43677 76 aa8.29□□□□□ -1.08
TSPAN4-215ENST00000525334 MT1BP07438 61 aa8.28□□□□□ -1.08
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.27□□□□□ -1.09
TSPAN4-215ENST00000525334 Q5VV11 94 aa8.26□□□□□ -1.09
TSPAN4-215ENST00000525334 IMUPQ9GZP8 106 aa8.25□□□□□ -1.09
TSPAN4-215ENST00000525334 SCGB1A1P11684 91 aa8.24□□□□□ -1.09
TSPAN4-215ENST00000525334 H3BPC8 53 aa8.23□□□□□ -1.09
TSPAN4-215ENST00000525334 H0YAA0 97 aa8.21□□□□□ -1.1
TSPAN4-215ENST00000525334 CRIPTQ9P021 101 aa8.21□□□□□ -1.1
TSPAN4-215ENST00000525334 A6NN06 94 aa8.14□□□□□ -1.11
TSPAN4-215ENST00000525334 MT-ATP8P03928 68 aa8.14□□□□□ -1.11
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.14□□□□□ -1.11
TSPAN4-215ENST00000525334 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.13□□□□□ -1.11
TSPAN4-215ENST00000525334 K7ERU9 68 aa8.12□□□□□ -1.11
TSPAN4-215ENST00000525334 DMAC1Q96GE9 116 aa8.12□□□□□ -1.11
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP10-5P60370 271 aa8.06□□□□□ -1.12
TSPAN4-215ENST00000525334 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.03□□□□□ -1.12
TSPAN4-215ENST00000525334 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.02□□□□□ -1.13
TSPAN4-215ENST00000525334 P0C880 135 aa7.96□□□□□ -1.14
TSPAN4-215ENST00000525334 NEBP20929 6669 aa7.94□□□□□ -1.14
TSPAN4-215ENST00000525334 C20orf197Q8N268 126 aa7.93□□□□□ -1.14
TSPAN4-215ENST00000525334 ACYP2P14621 99 aa7.91□□□□□ -1.14
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.91□□□□□ -1.14
TSPAN4-215ENST00000525334 R4GN34 69 aa7.91□□□□□ -1.14
TSPAN4-215ENST00000525334 SNURFQ9Y675 71 aa7.87□□□□□ -1.15
TSPAN4-215ENST00000525334 M0QZ58 72 aa7.86□□□□□ -1.15
TSPAN4-215ENST00000525334 PLAC4Q8WY50 150 aa7.82□□□□□ -1.16
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.81□□□□□ -1.16
TSPAN4-215ENST00000525334 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.8□□□□□ -1.16
TSPAN4-215ENST00000525334 MT1XP80297 61 aa7.79□□□□□ -1.16
TSPAN4-215ENST00000525334 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.78□□□□□ -1.16
TSPAN4-215ENST00000525334 SERP2Q8N6R1 65 aa7.78□□□□□ -1.16
TSPAN4-215ENST00000525334 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.78□□□□□ -1.16
TSPAN4-215ENST00000525334 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.77□□□□□ -1.17
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP5-9P26371 169 aa7.75□□□□□ -1.17
TSPAN4-215ENST00000525334 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.75□□□□□ -1.17
TSPAN4-215ENST00000525334 LINC01554Q52M75 96 aa7.74□□□□□ -1.17
TSPAN4-215ENST00000525334 KMT2DO14686 5537 aa7.65□□□□□ -1.18
TSPAN4-215ENST00000525334 MDN1Q9NU22 5596 aa7.58□□□□□ -1.2
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP12-2P59991 146 aa7.57□□□□□ -1.2
TSPAN4-215ENST00000525334 COX7CP15954 63 aa7.56□□□□□ -1.2
TSPAN4-215ENST00000525334 COA5Q86WW8 74 aa7.54□□□□□ -1.2
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN4-215ENST00000525334 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.49□□□□□ -1.21
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.48□□□□□ -1.21
TSPAN4-215ENST00000525334 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.46□□□□□ -1.22
TSPAN4-215ENST00000525334 H7BZZ5 65 aa7.44□□□□□ -1.22
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.44□□□□□ -1.22
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.44□□□□□ -1.22
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.42□□□□□ -1.22
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.42□□□□□ -1.22
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP10-12P60413 245 aa7.39□□□□□ -1.23
TSPAN4-215ENST00000525334 SPRR2EP22531 72 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN4-215ENST00000525334 SPRR2BP35325 72 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN4-215ENST00000525334 SPRR2AP35326 72 aa7.38□□□□□ -1.23
TSPAN4-215ENST00000525334 SEC61GP60059 68 aa7.35□□□□□ -1.23
TSPAN4-215ENST00000525334 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.34□□□□□ -1.23
TSPAN4-215ENST00000525334 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.33□□□□□ -1.24
TSPAN4-215ENST00000525334 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.31□□□□□ -1.24
TSPAN4-215ENST00000525334 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPAN4-215ENST00000525334 A0A0D9SG42 100 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN4-215ENST00000525334 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.25□□□□□ -1.25
TSPAN4-215ENST00000525334 A0A1B0GU33 70 aa7.24□□□□□ -1.25
TSPAN4-215ENST00000525334 CCDC179H3BU77 68 aa7.19□□□□□ -1.26
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN4-215ENST00000525334 A0A1B0GU69 56 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN4-215ENST00000525334 SPRR2DP22532 72 aa7.13□□□□□ -1.27
TSPAN4-215ENST00000525334 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.13□□□□□ -1.27
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP12-1P59990 96 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN4-215ENST00000525334 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TSPAN4-215ENST00000525334 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.03□□□□□ -1.28
TSPAN4-215ENST00000525334 A8MU10 97 aa7□□□□□ -1.29
TSPAN4-215ENST00000525334 LCE3BQ5TA77 95 aa6.96□□□□□ -1.3
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN4-215ENST00000525334 PRR15LQ9BU68 103 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN4-215ENST00000525334 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN4-215ENST00000525334 TMEM258P61165 79 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN4-215ENST00000525334 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN4-215ENST00000525334 MT1EP04732 61 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN4-215ENST00000525334 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.82□□□□□ -1.32
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN4-215ENST00000525334 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.81□□□□□ -1.32
TSPAN4-215ENST00000525334 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.79□□□□□ -1.32
TSPAN4-215ENST00000525334 TNP1P09430 55 aa6.73□□□□□ -1.33
TSPAN4-215ENST00000525334 UQCR11O14957 56 aa6.71□□□□□ -1.34
TSPAN4-215ENST00000525334 LCE3AQ5TA76 89 aa6.69□□□□□ -1.34
TSPAN4-215ENST00000525334 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TSPAN4-215ENST00000525334 MT1GP13640 62 aa6.64□□□□□ -1.35
TSPAN4-215ENST00000525334 MT1LQ93083 61 aa6.6□□□□□ -1.35
TSPAN4-215ENST00000525334 PP632Q6XCG6 107 aa6.59□□□□□ -1.35
TSPAN4-215ENST00000525334 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.2 ms