RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 ACYP1P07311 99 aa3.37□□□□□ -1.87
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.36□□□□□ -1.87
RRN3P1-201ENST00000514813 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.35□□□□□ -1.87
RRN3P1-201ENST00000514813 Q5W150 140 aa3.34□□□□□ -1.87
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00643Q86TS7 51 aa3.33□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00208Q96KT6 92 aa3.32□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 H0Y9P7 68 aa3.31□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC179H3BU77 68 aa3.3□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP10-10P60014 251 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 MT1HP80294 61 aa3.29□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.28□□□□□ -1.88
RRN3P1-201ENST00000514813 HRES1P13985 223 aa3.26□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BPC8 53 aa3.26□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 MT-ATP8P03928 68 aa3.25□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.25□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.24□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 UQCRQO14949 82 aa3.24□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.24□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.23□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 ATOX1O00244 68 aa3.22□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 CSAG1Q6PB30 78 aa3.21□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 S4R3F8 94 aa3.21□□□□□ -1.89
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 SNURFQ9Y675 71 aa3.21□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.19□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFC1O43677 76 aa3.19□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.19□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 C20orf197Q8N268 126 aa3.18□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 R4GN34 69 aa3.18□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.17□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM258P61165 79 aa3.15□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1B0GU33 70 aa3.15□□□□□ -1.9
RRN3P1-201ENST00000514813 MUC17Q685J3 4493 aa3.15□□□□□ -1.91
RRN3P1-201ENST00000514813 ROMO1P60602 79 aa3.14□□□□□ -1.91
RRN3P1-201ENST00000514813 KLKP1Q107X0 134 aa3.12□□□□□ -1.91
RRN3P1-201ENST00000514813 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.12□□□□□ -1.91
RRN3P1-201ENST00000514813 MT2AP02795 61 aa3.1□□□□□ -1.91
RRN3P1-201ENST00000514813 MT1FP04733 61 aa3.09□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.08□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 ACYP2P14621 99 aa3.08□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 SERP2Q8N6R1 65 aa3.08□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.06□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 USH2AO75445 5202 aa3.06□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 A6NN06 94 aa3.05□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.05□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.05□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.04□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.03□□□□□ -1.92
RRN3P1-201ENST00000514813 M0QZ58 72 aa3.02□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 P0C880 135 aa3.01□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 COX7CP15954 63 aa3□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 DMAC1Q96GE9 116 aa2.99□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.98□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 PLAC4Q8WY50 150 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A0D9SG42 100 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 LCE1FQ5T754 118 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 Q5VV11 94 aa2.97□□□□□ -1.93
RRN3P1-201ENST00000514813 COA5Q86WW8 74 aa2.96□□□□□ -1.94
RRN3P1-201ENST00000514813 MT3P25713 68 aa2.92□□□□□ -1.94
RRN3P1-201ENST00000514813 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.92□□□□□ -1.94
RRN3P1-201ENST00000514813 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.91□□□□□ -1.94
RRN3P1-201ENST00000514813 SSPOA2VEC9 5147 aa2.9□□□□□ -1.94
RRN3P1-201ENST00000514813 LCE3BQ5TA77 95 aa2.9□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.9□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1B0GU69 56 aa2.89□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 H7BZZ5 65 aa2.89□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 CRIPTQ9P021 101 aa2.88□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.87□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.86□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.86□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 Q1T7F1 81 aa2.86□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RRN3P1-201ENST00000514813 H0YAA0 97 aa2.83□□□□□ -1.96
RRN3P1-201ENST00000514813 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.82□□□□□ -1.96
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR15LQ9BU68 103 aa2.82□□□□□ -1.96
RRN3P1-201ENST00000514813 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.82□□□□□ -1.96
RRN3P1-201ENST00000514813 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.82□□□□□ -1.96
RRN3P1-201ENST00000514813 MT1BP07438 61 aa2.8□□□□□ -1.96
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.97
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.78□□□□□ -1.97
RRN3P1-201ENST00000514813 A8MU10 97 aa2.77□□□□□ -1.97
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.75□□□□□ -1.97
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.75□□□□□ -1.97
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.73□□□□□ -1.97
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP10-5P60370 271 aa2.72□□□□□ -1.97
RRN3P1-201ENST00000514813 UQCR11O14957 56 aa2.71□□□□□ -1.98
RRN3P1-201ENST00000514813 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.7□□□□□ -1.98
RRN3P1-201ENST00000514813 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.7□□□□□ -1.98
RRN3P1-201ENST00000514813 KMT2DO14686 5537 aa2.69□□□□□ -1.98
RRN3P1-201ENST00000514813 MT1XP80297 61 aa2.66□□□□□ -1.98
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