RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATOX1O00244 68 aa7.53□□□□□ -1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.53□□□□□ -1.2
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WVE0 104 aa7.51□□□□□ -1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A6NN06 94 aa7.49□□□□□ -1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0Y9P7 68 aa7.49□□□□□ -1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRIPTQ9P021 101 aa7.49□□□□□ -1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00643Q86TS7 51 aa7.48□□□□□ -1.21
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IMUPQ9GZP8 106 aa7.46□□□□□ -1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFC1O43677 76 aa7.44□□□□□ -1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A8MUN3 132 aa7.42□□□□□ -1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H0YAA0 97 aa7.42□□□□□ -1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP10-5P60370 271 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00208Q96KT6 92 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OCR1Q9BZK8 76 aa7.36□□□□□ -1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MP68P56378 58 aa7.35□□□□□ -1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.34□□□□□ -1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.34□□□□□ -1.23
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GV90 55 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BPC8 53 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 J3QR89 54 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEBP20929 6669 aa7.21□□□□□ -1.25
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCGB1A1P11684 91 aa7.18□□□□□ -1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-9P26371 169 aa7.17□□□□□ -1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMAC1Q96GE9 116 aa7.16□□□□□ -1.26
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C20orf197Q8N268 126 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 R4GN34 69 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLAC4Q8WY50 150 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 P0C880 135 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KMT2DO14686 5537 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT1XP80297 61 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 M0QZ58 72 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MDN1Q9NU22 5596 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACYP2P14621 99 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM20Q8N5G0 67 aa7□□□□□ -1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.97□□□□□ -1.29
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT-ATP8P03928 68 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP12-2P59991 146 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 K7ERU9 68 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC01554Q52M75 96 aa6.92□□□□□ -1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.91□□□□□ -1.3
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.88□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRR2EP22531 72 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRR2BP35325 72 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRR2AP35326 72 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNURFQ9Y675 71 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP10-12P60413 245 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SERP2Q8N6R1 65 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRR2DP22532 72 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COA5Q86WW8 74 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE3BQ5TA77 95 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BS24 57 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEC61GP60059 68 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COX7CP15954 63 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GU33 70 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H7BZZ5 65 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0D9SG42 100 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.37□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP12-1P59990 96 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT1EP04732 61 aa6.26□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A1B0GU69 56 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.18□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.14□□□□□ -1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A8MU10 97 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT1GP13640 62 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE1DQ5T752 114 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE4AQ5TA78 99 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC179H3BU77 68 aa6.06□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PP632Q6XCG6 107 aa6.06□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRR15LQ9BU68 103 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNP1P09430 55 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.8 ms