RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A6NN06 94 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATOX1O00244 68 aa6.77□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CRIPTQ9P021 101 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A087WVE0 104 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H0Y9P7 68 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IMUPQ9GZP8 106 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFC1O43677 76 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00643Q86TS7 51 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A8MUN3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H0YAA0 97 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP10-5P60370 271 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00208Q96KT6 92 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MP68P56378 58 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OCR1Q9BZK8 76 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BPC8 53 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCP4P48539 62 aa6.51□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 J3QR89 54 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NEBP20929 6669 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 K7ERU9 68 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-9P26371 169 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCGB1A1P11684 91 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C20orf197Q8N268 126 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DMAC1Q96GE9 116 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLAC4Q8WY50 150 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 R4GN34 69 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 P0C880 135 aa6.38□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT1XP80297 61 aa6.35□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KMT2DO14686 5537 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 M0QZ58 72 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACYP2P14621 99 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MDN1Q9NU22 5596 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP12-2P59991 146 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC01554Q52M75 96 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT-ATP8P03928 68 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRR2EP22531 72 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRR2BP35325 72 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRR2AP35326 72 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNURFQ9Y675 71 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.07□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP10-12P60413 245 aa6.05□□□□□ -1.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERP2Q8N6R1 65 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRR2DP22532 72 aa5.96□□□□□ -1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.96□□□□□ -1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.96□□□□□ -1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SVIPQ8NHG7 77 aa5.91□□□□□ -1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.9□□□□□ -1.46
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COA5Q86WW8 74 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEC61GP60059 68 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.84□□□□□ -1.47
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC179H3BU77 68 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE3BQ5TA77 95 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COX7CP15954 63 aa5.78□□□□□ -1.48
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0D9SG42 100 aa5.75□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1B0GU33 70 aa5.74□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H7BZZ5 65 aa5.71□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.68□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TMEM258P61165 79 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP12-1P59990 96 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.64□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT1EP04732 61 aa5.63□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A1B0GU69 56 aa5.6□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT1GP13640 62 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A8MU10 97 aa5.48□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PP632Q6XCG6 107 aa5.48□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRR15LQ9BU68 103 aa5.44□□□□□ -1.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TNP1P09430 55 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT1LQ93083 61 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT1MQ8N339 61 aa5.37□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE3AQ5TA76 89 aa5.36□□□□□ -1.55
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