RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	USH2A	O75445	5202 aa		5.26	□□□□□ -1.57
TTLL3-231	ENST00000496246	IMUP	Q9GZP8	106 aa		5.24	□□□□□ -1.57
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BPC8	53 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5.2	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246	CRIPT	Q9P021	101 aa		5.19	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SSPO	A2VEC9	5147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246		K7ERU9	68 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.18	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246		Q5VV11	94 aa		5.17	□□□□□ -1.58
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		5.15	□□□□□ -1.59
TTLL3-231	ENST00000496246		H0YAA0	97 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-231	ENST00000496246	C20orf197	Q8N268	126 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTLL3-231	ENST00000496246	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TTLL3-231	ENST00000496246		A6NN06	94 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	ACYP2	P14621	99 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	MT-ATP8	P03928	68 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TTLL3-231	ENST00000496246	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTLL3-231	ENST00000496246		R4GN34	69 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TTLL3-231	ENST00000496246	MT1B	P07438	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TTLL3-231	ENST00000496246		M0QZ58	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL3-231	ENST00000496246		P0C880	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL3-231	ENST00000496246	SEC61G	P60059	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TTLL3-231	ENST00000496246	COX7C	P15954	63 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TTLL3-231	ENST00000496246	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TTLL3-231	ENST00000496246	COA5	Q86WW8	74 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TTLL3-231	ENST00000496246	MT1X	P80297	61 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TTLL3-231	ENST00000496246	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTLL3-231	ENST00000496246	NEB	P20929	6669 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTLL3-231	ENST00000496246		H7BZZ5	65 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GU33	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GU69	56 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0D9SG42	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR2E	P22531	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR2B	P35325	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR2A	P35326	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	PCP4	P48539	62 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KMT2D	O14686	5537 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TTLL3-231	ENST00000496246	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR2D	P22532	72 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM258	P61165	79 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.33	□□□□□ -1.72
TTLL3-231	ENST00000496246		A8MU10	97 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TTLL3-231	ENST00000496246	UQCR11	O14957	56 aa		4.31	□□□□□ -1.72
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.3	□□□□□ -1.72
TTLL3-231	ENST00000496246	TNP1	P09430	55 aa		4.29	□□□□□ -1.72
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0A0MQY5	61 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TTLL3-231	ENST00000496246		K7ERS5	55 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TTLL3-231	ENST00000496246		V9GYY9	64 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TTLL3-231	ENST00000496246	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.2	□□□□□ -1.74
TTLL3-231	ENST00000496246	MT1E	P04732	61 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TTLL3-231	ENST00000496246	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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