RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-241ENST00000487169 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-241ENST00000487169 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH2Q9P225 4427 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-241ENST00000487169 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP12-2P59991 146 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-241ENST00000487169 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-241ENST00000487169 MT1HL1P0DM35 61 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-241ENST00000487169 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.4□□□□□ -1.39
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP12-1P59990 96 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-241ENST00000487169 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-241ENST00000487169 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-241ENST00000487169 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-241ENST00000487169 FAT1Q14517 4588 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-241ENST00000487169 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-241ENST00000487169 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-241ENST00000487169 PKHD1P08F94 4074 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-241ENST00000487169 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-241ENST00000487169 PKD1P98161 4303 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-241ENST00000487169 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
HDLBP-241ENST00000487169 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HDLBP-241ENST00000487169 MYCBP2O75592 4640 aa5.94□□□□□ -1.46
HDLBP-241ENST00000487169 RYR2Q92736 4967 aa5.91□□□□□ -1.46
HDLBP-241ENST00000487169 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-12P60413 245 aa5.86□□□□□ -1.47
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.85□□□□□ -1.47
HDLBP-241ENST00000487169 RYR3Q15413 4870 aa5.81□□□□□ -1.48
HDLBP-241ENST00000487169 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.8□□□□□ -1.48
HDLBP-241ENST00000487169 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
HDLBP-241ENST00000487169 RYR1P21817 5038 aa5.78□□□□□ -1.48
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.75□□□□□ -1.49
HDLBP-241ENST00000487169 HSPG2P98160 4391 aa5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-241ENST00000487169 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.74□□□□□ -1.49
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP12-3P60328 96 aa5.71□□□□□ -1.5
HDLBP-241ENST00000487169 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.7□□□□□ -1.5
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-241ENST00000487169 TNXBP22105 4242 aa5.65□□□□□ -1.5
HDLBP-241ENST00000487169 LRP2P98164 4655 aa5.63□□□□□ -1.51
HDLBP-241ENST00000487169 LCE3AQ5TA76 89 aa5.62□□□□□ -1.51
HDLBP-241ENST00000487169 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.56□□□□□ -1.52
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.56□□□□□ -1.52
HDLBP-241ENST00000487169 HERC2O95714 4834 aa5.51□□□□□ -1.53
HDLBP-241ENST00000487169 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HDLBP-241ENST00000487169 MT1HP80294 61 aa5.5□□□□□ -1.53
HDLBP-241ENST00000487169 LPAP08519 4548 aa5.5□□□□□ -1.53
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.47□□□□□ -1.53
HDLBP-241ENST00000487169 MT2AP02795 61 aa5.46□□□□□ -1.54
HDLBP-241ENST00000487169 INE1O15225 51 aa5.4□□□□□ -1.54
HDLBP-241ENST00000487169 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.38□□□□□ -1.55
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.37□□□□□ -1.55
HDLBP-241ENST00000487169 MT1FP04733 61 aa5.35□□□□□ -1.55
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-5P60370 271 aa5.24□□□□□ -1.57
HDLBP-241ENST00000487169 MUC2Q02817 5179 aa5.15□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.14□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.11□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 MUC17Q685J3 4493 aa5.11□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.1□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.1□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.09□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.09□□□□□ -1.59
HDLBP-241ENST00000487169 HERC1Q15751 4861 aa5.07□□□□□ -1.6
HDLBP-241ENST00000487169 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
HDLBP-241ENST00000487169 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.02□□□□□ -1.61
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
HDLBP-241ENST00000487169 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.95□□□□□ -1.62
HDLBP-241ENST00000487169 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.94□□□□□ -1.62
HDLBP-241ENST00000487169 LCE2CQ5TA81 110 aa4.93□□□□□ -1.62
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.91□□□□□ -1.62
HDLBP-241ENST00000487169 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.91□□□□□ -1.62
HDLBP-241ENST00000487169 RNF213Q63HN8 5207 aa4.9□□□□□ -1.63
HDLBP-241ENST00000487169 MT1BP07438 61 aa4.88□□□□□ -1.63
HDLBP-241ENST00000487169 MT1XP80297 61 aa4.88□□□□□ -1.63
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.86□□□□□ -1.63
HDLBP-241ENST00000487169 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.83□□□□□ -1.64
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.78□□□□□ -1.64
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.76□□□□□ -1.65
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.76□□□□□ -1.65
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR2EP22531 72 aa4.75□□□□□ -1.65
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR2BP35325 72 aa4.75□□□□□ -1.65
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR2AP35326 72 aa4.75□□□□□ -1.65
HDLBP-241ENST00000487169 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.73□□□□□ -1.65
HDLBP-241ENST00000487169 MT1GP13640 62 aa4.64□□□□□ -1.67
HDLBP-241ENST00000487169 LCE2BO14633 110 aa4.61□□□□□ -1.67
HDLBP-241ENST00000487169 LCE3BQ5TA77 95 aa4.61□□□□□ -1.67
HDLBP-241ENST00000487169 SPRR2DP22532 72 aa4.58□□□□□ -1.68
HDLBP-241ENST00000487169 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP12-4P60329 112 aa4.52□□□□□ -1.69
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.48□□□□□ -1.69
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