RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483778.5

ATG4B-221, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 1,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP5-9P26371 169 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-221ENST00000483778 ACYP1P07311 99 aa7.8□□□□□ -1.16
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.79□□□□□ -1.16
ATG4B-221ENST00000483778 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.76□□□□□ -1.17
ATG4B-221ENST00000483778 CRIPTQ9P021 101 aa7.75□□□□□ -1.17
ATG4B-221ENST00000483778 KMT2DO14686 5537 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-221ENST00000483778 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.74□□□□□ -1.17
ATG4B-221ENST00000483778 IMUPQ9GZP8 106 aa7.73□□□□□ -1.17
ATG4B-221ENST00000483778 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.71□□□□□ -1.18
ATG4B-221ENST00000483778 J3QR89 54 aa7.68□□□□□ -1.18
ATG4B-221ENST00000483778 MDN1Q9NU22 5596 aa7.66□□□□□ -1.18
ATG4B-221ENST00000483778 H0YAA0 97 aa7.64□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 NDUFC1O43677 76 aa7.64□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.64□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 H0Y9P7 68 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.62□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 LINC00643Q86TS7 51 aa7.61□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 UQCRQO14949 82 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 MT1XP80297 61 aa7.6□□□□□ -1.19
ATG4B-221ENST00000483778 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4B-221ENST00000483778 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.55□□□□□ -1.2
ATG4B-221ENST00000483778 A8MUN3 132 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.54□□□□□ -1.2
ATG4B-221ENST00000483778 ATOX1O00244 68 aa7.53□□□□□ -1.2
ATG4B-221ENST00000483778 K7ERU9 68 aa7.51□□□□□ -1.21
ATG4B-221ENST00000483778 SPRR2EP22531 72 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-221ENST00000483778 SPRR2BP35325 72 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-221ENST00000483778 SPRR2AP35326 72 aa7.5□□□□□ -1.21
ATG4B-221ENST00000483778 LINC00208Q96KT6 92 aa7.49□□□□□ -1.21
ATG4B-221ENST00000483778 P0C880 135 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-221ENST00000483778 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-221ENST00000483778 PLAC4Q8WY50 150 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-221ENST00000483778 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4B-221ENST00000483778 OCR1Q9BZK8 76 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP12-2P59991 146 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-221ENST00000483778 R4GN34 69 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-221ENST00000483778 M0QZ58 72 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-221ENST00000483778 MP68P56378 58 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-221ENST00000483778 MT-ATP8P03928 68 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-221ENST00000483778 SCGB1A1P11684 91 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-221ENST00000483778 LINC01554Q52M75 96 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ATG4B-221ENST00000483778 DMAC1Q96GE9 116 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG4B-221ENST00000483778 C20orf197Q8N268 126 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG4B-221ENST00000483778 SPRR2DP22532 72 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-221ENST00000483778 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-221ENST00000483778 H3BPC8 53 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP10-12P60413 245 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-221ENST00000483778 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-221ENST00000483778 LCE3BQ5TA77 95 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4B-221ENST00000483778 ACYP2P14621 99 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-221ENST00000483778 SERP2Q8N6R1 65 aa7.01□□□□□ -1.29
ATG4B-221ENST00000483778 SNURFQ9Y675 71 aa6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-221ENST00000483778 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG4B-221ENST00000483778 COX7CP15954 63 aa6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-221ENST00000483778 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-221ENST00000483778 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.81□□□□□ -1.32
ATG4B-221ENST00000483778 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-221ENST00000483778 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4B-221ENST00000483778 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-221ENST00000483778 MT1EP04732 61 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-221ENST00000483778 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.72□□□□□ -1.33
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-221ENST00000483778 H7BZZ5 65 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-221ENST00000483778 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-221ENST00000483778 CCDC179H3BU77 68 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-221ENST00000483778 A0A0D9SG42 100 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-221ENST00000483778 COA5Q86WW8 74 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4B-221ENST00000483778 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.57□□□□□ -1.36
ATG4B-221ENST00000483778 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.55□□□□□ -1.36
ATG4B-221ENST00000483778 MT1GP13640 62 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-221ENST00000483778 LCE1DQ5T752 114 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-221ENST00000483778 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-221ENST00000483778 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP12-1P59990 96 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4B-221ENST00000483778 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-221ENST00000483778 A0A1B0GU33 70 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-221ENST00000483778 TMEM258P61165 79 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-221ENST00000483778 MT1MQ8N339 61 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-221ENST00000483778 SEC61GP60059 68 aa6.42□□□□□ -1.38
ATG4B-221ENST00000483778 MT4P47944 62 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4B-221ENST00000483778 MT1LQ93083 61 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4B-221ENST00000483778 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-221ENST00000483778 PP632Q6XCG6 107 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-221ENST00000483778 LCE4AQ5TA78 99 aa6.35□□□□□ -1.39
ATG4B-221ENST00000483778 LCE3AQ5TA76 89 aa6.3□□□□□ -1.4
ATG4B-221ENST00000483778 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.3□□□□□ -1.4
ATG4B-221ENST00000483778 A8MU10 97 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-221ENST00000483778 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108 ms