RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.17□□□□□ -1.74
SMARCE1-210ENST00000481231 S4R3F8 94 aa4.17□□□□□ -1.74
SMARCE1-210ENST00000481231 CXCL6P80162 114 aa4.16□□□□□ -1.74
SMARCE1-210ENST00000481231 LCA10Q71F78 164 aa4.15□□□□□ -1.75
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf118A6NHY6 69 aa4.14□□□□□ -1.75
SMARCE1-210ENST00000481231 KLKP1Q107X0 134 aa4.13□□□□□ -1.75
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.13□□□□□ -1.75
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BT86 120 aa4.12□□□□□ -1.75
SMARCE1-210ENST00000481231 LCE1DQ5T752 114 aa4.1□□□□□ -1.75
SMARCE1-210ENST00000481231 IMUPQ9GZP8 106 aa4.1□□□□□ -1.75
SMARCE1-210ENST00000481231 TSTD3H0UI37 97 aa4.09□□□□□ -1.75
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SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.07□□□□□ -1.76
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PPM0 123 aa4.05□□□□□ -1.76
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.05□□□□□ -1.76
SMARCE1-210ENST00000481231 CRIPTQ9P021 101 aa4.05□□□□□ -1.76
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.04□□□□□ -1.76
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.04□□□□□ -1.76
SMARCE1-210ENST00000481231 TAX1BP3O14907 124 aa4.03□□□□□ -1.76
SMARCE1-210ENST00000481231 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
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SMARCE1-210ENST00000481231 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.01□□□□□ -1.77
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM6P0DI80 62 aa4□□□□□ -1.77
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.98□□□□□ -1.77
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SMARCE1-210ENST00000481231 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.95□□□□□ -1.78
SMARCE1-210ENST00000481231 H0YAA0 97 aa3.94□□□□□ -1.78
SMARCE1-210ENST00000481231 PRO0461Q9UI25 63 aa3.94□□□□□ -1.78
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SMARCE1-210ENST00000481231 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.91□□□□□ -1.78
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SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.87□□□□□ -1.79
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.86□□□□□ -1.79
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SMARCE1-210ENST00000481231 H0Y9P7 68 aa3.83□□□□□ -1.8
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SMARCE1-210ENST00000481231 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.82□□□□□ -1.8
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SMARCE1-210ENST00000481231 ATOX1O00244 68 aa3.81□□□□□ -1.8
SMARCE1-210ENST00000481231 UQCRQO14949 82 aa3.81□□□□□ -1.8
SMARCE1-210ENST00000481231 P0C880 135 aa3.81□□□□□ -1.8
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.81□□□□□ -1.8
SMARCE1-210ENST00000481231 R4GN34 69 aa3.81□□□□□ -1.8
SMARCE1-210ENST00000481231 ETDBQ3ZM63 59 aa3.8□□□□□ -1.8
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SMARCE1-210ENST00000481231 M0QZ58 72 aa3.78□□□□□ -1.8
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SMARCE1-210ENST00000481231 C20orf197Q8N268 126 aa3.76□□□□□ -1.81
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
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SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.71□□□□□ -1.82
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SMARCE1-210ENST00000481231 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.67□□□□□ -1.82
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SMARCE1-210ENST00000481231 DMAC1Q96GE9 116 aa3.66□□□□□ -1.82
SMARCE1-210ENST00000481231 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.64□□□□□ -1.83
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00643Q86TS7 51 aa3.62□□□□□ -1.83
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SMARCE1-210ENST00000481231 H3BPC8 53 aa3.59□□□□□ -1.83
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SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.54□□□□□ -1.84
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SMARCE1-210ENST00000481231 ACYP2P14621 99 aa3.5□□□□□ -1.85
SMARCE1-210ENST00000481231 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.5□□□□□ -1.85
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGB1A1P11684 91 aa3.49□□□□□ -1.85
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.48□□□□□ -1.85
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.48□□□□□ -1.85
SMARCE1-210ENST00000481231 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.48□□□□□ -1.85
SMARCE1-210ENST00000481231 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.45□□□□□ -1.86
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.41□□□□□ -1.86
SMARCE1-210ENST00000481231 MT1GP13640 62 aa3.4□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.4□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0D9SG42 100 aa3.38□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 PP632Q6XCG6 107 aa3.37□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 MT1MQ8N339 61 aa3.36□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GV90 55 aa3.35□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 J3QR89 54 aa3.35□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.35□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.34□□□□□ -1.87
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.33□□□□□ -1.88
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