RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466676.5

RUNDC3B-204, Transcript of RUN domain containing 3B, human

TSL 2

Gene RUNDC3B, Length 582 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A1W2PNN7	141 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPINK7	P58062	85 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.4	□□□□□ -1.54
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A8MU10	97 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	UQCR11	O14957	56 aa		5.39	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC01554	Q52M75	96 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.38	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00313	P59037	77 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676		Q96NJ1	140 aa		5.37	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.36	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.34	□□□□□ -1.55
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TNXB	P22105	4242 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LRP2	P98164	4655 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PANO1	I0J062	215 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP10-8	P60410	259 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ZNF861P	O60384	105 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676		Q5W150	140 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RUNDC3B-204	ENST00000466676		K7ERS5	55 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.18	□□□□□ -1.58
RUNDC3B-204	ENST00000466676	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.12	□□□□□ -1.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LPA	P08519	4548 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC2	Q02817	5179 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A8MUU9	505 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A1B0GU33	70 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPINK1	P00995	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	TPRXL	Q17RH7	258 aa		5	□□□□□ -1.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	ROMO1	P60602	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676		H0YAA0	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A0A0MQY5	61 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RUNDC3B-204	ENST00000466676		P0C880	135 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RUNDC3B-204	ENST00000466676		M0R2T5	61 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RUNDC3B-204	ENST00000466676		S4R3F8	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1H	P80294	61 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RUNDC3B-204	ENST00000466676		M0QZ58	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RUNDC3B-204	ENST00000466676		A0A0D9SG42	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RUNDC3B-204	ENST00000466676	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.48	□□□□□ -1.69
RUNDC3B-204	ENST00000466676	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RUNDC3B-204	ENST00000466676	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RUNDC3B-204	ENST00000466676	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.32	□□□□□ -1.72
RUNDC3B-204	ENST00000466676		R4GN34	69 aa		4.32	□□□□□ -1.72
RUNDC3B-204	ENST00000466676	USH2A	O75445	5202 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RUNDC3B-204	ENST00000466676	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT2A	P02795	61 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RUNDC3B-204	ENST00000466676	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RUNDC3B-204	ENST00000466676	MT1F	P04733	61 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RUNDC3B-204	ENST00000466676	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.17	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms