RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461134.1

TTPAL-205, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 2

Gene TTPAL, Length 3,455 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-205ENST00000461134 SPRR1BP22528 89 aa4.65□□□□□ -1.67
TTPAL-205ENST00000461134 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.64□□□□□ -1.67
TTPAL-205ENST00000461134 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TTPAL-205ENST00000461134 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.62□□□□□ -1.67
TTPAL-205ENST00000461134 RNF213Q63HN8 5207 aa4.6□□□□□ -1.67
TTPAL-205ENST00000461134 H0YAA0 97 aa4.6□□□□□ -1.67
TTPAL-205ENST00000461134 LUZP6Q538Z0 58 aa4.59□□□□□ -1.67
TTPAL-205ENST00000461134 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.58□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 A0A1B0GU33 70 aa4.58□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.57□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 Q6ZSA8 131 aa4.57□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 HSPG2P98160 4391 aa4.56□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 LRP2P98164 4655 aa4.55□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.54□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.53□□□□□ -1.68
TTPAL-205ENST00000461134 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.51□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 C9orf92A6NGG3 77 aa4.51□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.5□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.49□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.49□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.48□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 PKD1P98161 4303 aa4.47□□□□□ -1.69
TTPAL-205ENST00000461134 A0A0D9SG42 100 aa4.45□□□□□ -1.7
TTPAL-205ENST00000461134 TPRXLQ17RH7 258 aa4.45□□□□□ -1.7
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.45□□□□□ -1.7
TTPAL-205ENST00000461134 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.44□□□□□ -1.7
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.42□□□□□ -1.7
TTPAL-205ENST00000461134 MUC2Q02817 5179 aa4.42□□□□□ -1.7
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.41□□□□□ -1.7
TTPAL-205ENST00000461134 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.38□□□□□ -1.71
TTPAL-205ENST00000461134 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.37□□□□□ -1.71
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
TTPAL-205ENST00000461134 LCE2BO14633 110 aa4.33□□□□□ -1.72
TTPAL-205ENST00000461134 LPAP08519 4548 aa4.33□□□□□ -1.72
TTPAL-205ENST00000461134 MT1HL1P0DM35 61 aa4.31□□□□□ -1.72
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP10-8P60410 259 aa4.28□□□□□ -1.72
TTPAL-205ENST00000461134 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.24□□□□□ -1.73
TTPAL-205ENST00000461134 M0R2T5 61 aa4.21□□□□□ -1.74
TTPAL-205ENST00000461134 S4R3F8 94 aa4.2□□□□□ -1.74
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.18□□□□□ -1.74
TTPAL-205ENST00000461134 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.17□□□□□ -1.74
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.17□□□□□ -1.74
TTPAL-205ENST00000461134 LCE2CQ5TA81 110 aa4.15□□□□□ -1.74
TTPAL-205ENST00000461134 PLAC4Q8WY50 150 aa4.15□□□□□ -1.75
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP12-2P59991 146 aa4.12□□□□□ -1.75
TTPAL-205ENST00000461134 XP32Q5T750 250 aa4.1□□□□□ -1.75
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
TTPAL-205ENST00000461134 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.09□□□□□ -1.76
TTPAL-205ENST00000461134 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
TTPAL-205ENST00000461134 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.02□□□□□ -1.77
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP12-1P59990 96 aa4.02□□□□□ -1.77
TTPAL-205ENST00000461134 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
TTPAL-205ENST00000461134 TNXBP22105 4242 aa3.97□□□□□ -1.77
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.95□□□□□ -1.78
TTPAL-205ENST00000461134 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
TTPAL-205ENST00000461134 USH2AO75445 5202 aa3.89□□□□□ -1.79
TTPAL-205ENST00000461134 M0QZ58 72 aa3.87□□□□□ -1.79
TTPAL-205ENST00000461134 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.84□□□□□ -1.79
TTPAL-205ENST00000461134 R4GN34 69 aa3.82□□□□□ -1.8
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP10-10P60014 251 aa3.79□□□□□ -1.8
TTPAL-205ENST00000461134 PP632Q6XCG6 107 aa3.77□□□□□ -1.81
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.77□□□□□ -1.81
TTPAL-205ENST00000461134 MUC17Q685J3 4493 aa3.71□□□□□ -1.82
TTPAL-205ENST00000461134 MT1HP80294 61 aa3.69□□□□□ -1.82
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.67□□□□□ -1.82
TTPAL-205ENST00000461134 INE1O15225 51 aa3.65□□□□□ -1.83
TTPAL-205ENST00000461134 SSPOA2VEC9 5147 aa3.61□□□□□ -1.83
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.57□□□□□ -1.84
TTPAL-205ENST00000461134 TNP1P09430 55 aa3.57□□□□□ -1.84
TTPAL-205ENST00000461134 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.56□□□□□ -1.84
TTPAL-205ENST00000461134 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.55□□□□□ -1.84
TTPAL-205ENST00000461134 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.53□□□□□ -1.84
TTPAL-205ENST00000461134 MT1FP04733 61 aa3.51□□□□□ -1.85
TTPAL-205ENST00000461134 MT2AP02795 61 aa3.5□□□□□ -1.85
TTPAL-205ENST00000461134 KMT2DO14686 5537 aa3.46□□□□□ -1.86
TTPAL-205ENST00000461134 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TTPAL-205ENST00000461134 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.43□□□□□ -1.86
TTPAL-205ENST00000461134 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TTPAL-205ENST00000461134 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TTPAL-205ENST00000461134 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.39□□□□□ -1.87
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.36□□□□□ -1.87
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.3□□□□□ -1.88
TTPAL-205ENST00000461134 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.29□□□□□ -1.88
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.29□□□□□ -1.88
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.29□□□□□ -1.88
TTPAL-205ENST00000461134 LCE3AQ5TA76 89 aa3.27□□□□□ -1.89
TTPAL-205ENST00000461134 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.26□□□□□ -1.89
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TTPAL-205ENST00000461134 MDN1Q9NU22 5596 aa3.18□□□□□ -1.9
TTPAL-205ENST00000461134 MT1BP07438 61 aa3.17□□□□□ -1.9
TTPAL-205ENST00000461134 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.16□□□□□ -1.9
TTPAL-205ENST00000461134 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.15□□□□□ -1.91
TTPAL-205ENST00000461134 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.13□□□□□ -1.91
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.13□□□□□ -1.91
TTPAL-205ENST00000461134 KRTAP12-3P60328 96 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms