RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 hDV103S1A0JD37 113 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 Q5W150 140 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 MT2AP02795 61 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 LCA10Q71F78 164 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 MT1FP04733 61 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 ETDBQ3ZM63 59 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC179H3BU77 68 aa3.41□□□□□ -1.86
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.39□□□□□ -1.87
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RABGEF1-206ENST00000461017 BRK1Q8WUW1 75 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM258P61165 79 aa3.38□□□□□ -1.87
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV2-30P06310 120 aa3.37□□□□□ -1.87
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RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP10-10P60014 251 aa3.35□□□□□ -1.87
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RABGEF1-206ENST00000461017 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGEF1-206ENST00000461017 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCRQO14949 82 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01554Q52M75 96 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGEF1-206ENST00000461017 SSPOA2VEC9 5147 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGEF1-206ENST00000461017 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WVE0 104 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGEF1-206ENST00000461017 ACYP1P07311 99 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1-206ENST00000461017 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.26□□□□□ -1.89
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RABGEF1-206ENST00000461017 K7ERS5 55 aa3.25□□□□□ -1.89
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RABGEF1-206ENST00000461017 MT-ATP8P03928 68 aa3.24□□□□□ -1.89
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.22□□□□□ -1.89
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RABGEF1-206ENST00000461017 H0Y9P7 68 aa3.2□□□□□ -1.9
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RABGEF1-206ENST00000461017 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NED7 52 aa3.17□□□□□ -1.9
RABGEF1-206ENST00000461017 CSAG1Q6PB30 78 aa3.17□□□□□ -1.9
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RABGEF1-206ENST00000461017 H0YAA0 97 aa3.06□□□□□ -1.92
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RABGEF1-206ENST00000461017 R4GN34 69 aa2.93□□□□□ -1.94
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.91□□□□□ -1.94
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RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP5-9P26371 169 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1-206ENST00000461017 PLAC4Q8WY50 150 aa2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.88□□□□□ -1.95
RABGEF1-206ENST00000461017 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.86□□□□□ -1.95
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.86□□□□□ -1.95
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