RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-205ENST00000450873 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SPINK7P58062 85 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GVX0 72 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGEF1-205ENST00000450873 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAC1Q96KF2 57 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 PCOTHQ58A44 107 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 A8MUU9 505 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGEF1-205ENST00000450873 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGEF1-205ENST00000450873 HRES1P13985 223 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-205ENST00000450873 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
RABGEF1-205ENST00000450873 ACYP2P14621 99 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGEF1-205ENST00000450873 UQCR11O14957 56 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GU69 56 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-205ENST00000450873 CSAG1Q6PB30 78 aa5.53□□□□□ -1.52
RABGEF1-205ENST00000450873 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE2CQ5TA81 110 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGEF1-205ENST00000450873 DMAC1Q96GE9 116 aa5.46□□□□□ -1.53
RABGEF1-205ENST00000450873 ROMO1P60602 79 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-205ENST00000450873 MT1HP80294 61 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-205ENST00000450873 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.45□□□□□ -1.54
RABGEF1-205ENST00000450873 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-205ENST00000450873 Q5W150 140 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-205ENST00000450873 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
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RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV2-30P06310 120 aa5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-205ENST00000450873 M0R2T5 61 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-205ENST00000450873 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-205ENST00000450873 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-205ENST00000450873 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-205ENST00000450873 P0C880 135 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A0A0MQY5 61 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-205ENST00000450873 K7ERS5 55 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-205ENST00000450873 H0YAA0 97 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGEF1-205ENST00000450873 S4R3F8 94 aa5.1□□□□□ -1.59
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GU33 70 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-205ENST00000450873 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE2BO14633 110 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-205ENST00000450873 MT2AP02795 61 aa5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.04□□□□□ -1.6
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFAF8A1L188 74 aa5.04□□□□□ -1.6
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP10-10P60014 251 aa5.01□□□□□ -1.61
RABGEF1-205ENST00000450873 MT1FP04733 61 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5□□□□□ -1.61
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.99□□□□□ -1.61
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-205ENST00000450873 CRIPTQ9P021 101 aa4.96□□□□□ -1.62
RABGEF1-205ENST00000450873 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.86□□□□□ -1.63
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RABGEF1-205ENST00000450873 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-205ENST00000450873 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.72□□□□□ -1.65
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.71□□□□□ -1.66
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RABGEF1-205ENST00000450873 R4GN34 69 aa4.68□□□□□ -1.66
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RABGEF1-205ENST00000450873 M0QZ58 72 aa4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP12-2P59991 146 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP12-1P59990 96 aa4.6□□□□□ -1.67
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP10-5P60370 271 aa4.52□□□□□ -1.69
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RABGEF1-205ENST00000450873 NEBP20929 6669 aa4.51□□□□□ -1.69
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RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP5-9P26371 169 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-205ENST00000450873 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-205ENST00000450873 MT1XP80297 61 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-205ENST00000450873 PP632Q6XCG6 107 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-205ENST00000450873 KMT2DO14686 5537 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGEF1-205ENST00000450873 MDN1Q9NU22 5596 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 LCE3BQ5TA77 95 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.25□□□□□ -1.73
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